医学信息检索与利用重点归纳昆医.docx
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医学信息检索与利用重点归纳昆医
结合实际谈谈医学信息检索与利用课的意义、教学目标、教学内容:
结合实际:
由于信息社会信息资源日益庞大,增长传播速度过快;信息资源成为最重要的资源;知识的半衰期缩短,每个人需要及时更新新知识;医学文献的特点:
数量大,增长快,学科交叉,分散重复;载体形式多样化;学习型、创新型社会,终身学习、自我学习的要求。
意义:
是必备的基本技能;是科学研究的先期工作;贯穿科研工作的始终;是打开知识宝库的钥匙;是开发信息资源的有效途径;信息检索是科研工作的前提和基础;信息检索可以节约资财、减少浪费、提高效率;信息检索可拓宽视野、开阔思路、提高信息素质和创新能力;信息检索是科学决策的前提。
教学目标:
在于培养和提高学生的信息素养,继而提高自学和研究能力。
信息素养是自学、科研、创新的基础。
教学内容:
是科学技术迅速发展的现代信息社会应运而生的产物,是一门专门研究如何获取所需信息的科学方法课涉及医学、情报学、文献学、信息学、计算机、网络等多学科知识。
信息素养的内涵:
包括信息获取的意识,评价、判断信息的能力,查找、收集、组织信息的能力,信息决策及处理能力。
信息素养的能力标准(ACRL标准):
①能够确认信息需求的特性与范围②能有效而又高效地获取所需要的信息③能评判性地评价信息及其来源,并能把所筛选的信息融入自己的知识基础 ④能有效地利用信息去完成一个具体任务⑤了解利用信息过程中所涉及的经济、法律和社会问题,合理、合法地检索、搜集和利用信息。
信息源:
个人为满足其信息需要而获得信息的来源。
信息:
信息是用语言、文字、数字、符号、图象、声音、情景、表情、状态等方式传递的内容。
信息的3个基本属性:
客观性、可知性、传递性。
知识:
人们在认识和改造客观世界的实践中所获得的认识和经验的总和。
是人类通过对信息的感知、获取、选择、处理、加工等一系列思维过程,形成的对客观事物的本质和规律的认识。
从信息论角度看,知识是人类大脑中重新组合形成的序列化信息。
情报:
是为了解决某一特定问题区搜索而来的所需要的知识,他是激活了的知识。
情报就是运用一定的形式传递给用户,并产生效用的知识和信息。
三个基本属性:
知识性、传递性、效用性。
文献:
文献是记录有知识的一切载体。
文献的四个基本要素:
1、记录知识的具体内容;2、记录知识的手段;3、记录知识的物质载体;4、记录知识的表现形态。
四者之间的关系:
信息是知识的源泉,知识是系统化、理论化的信息,情报是活化的知识和信息。
情报应用于实践,解决实践中的问题,产生新的信息。
文献的类型:
1、按加工深度划分:
从一次文献到二次文献、三次文献,是对知识与信息进行系统整理、有序化和高度浓缩、提炼、再创造的过程,是知识与信息从无序到有序的结构化、系统化的过程。
。
①一次文献(原始信息):
指记录原始的创造,即首次记录科研成果,新技术,新知识,新发明,新见解的文献;例子:
期刊论文、学位论文、科研报告、专利文献、会议文献。
②二次文献(检索工具类):
对一次文献搜集、加工、整理、标引,记录文献中的题名、著者、刊登原文的期刊名称、年、卷期页、摘要等特征,并按某个特征的顺序排列,供查找文献线索的文献;例子:
Medline数据库。
③三次文献:
利用二次文献,查阅一次文献的基础上,分析综合归纳信息后,组织形成具有资料性、查考性、阅读性的文献;例子:
教科书、综述、工具书、进展、调查报告等;综述:
指综合分析和描述一定时间范围内,某一学科或专业科研发展、现状、并预测未来的一类文献。
④零次文献:
指未经正式发表或未形成正规载体的一种文献形式;特点:
客观性,零散性,不成熟性;例子:
书信,手稿,会议记录,笔记等。
2、按载体类型划分:
手写型、印刷型、缩微型、视听型、电子型。
3、文献按出版形式分为:
图书;科技期刊;专利文献;会议文献;科技报告;标准文献;国际机构和政府出版物;学位论文;技术档案;产品资料;报纸、通报。
现代医学文献发展特点①迅速增长,数量庞大②文种多样③发表分散、内容重复④文献寿命缩短⑤类型繁多,迅速向电子化、网络化和数字化方向发展。
文献特征信息:
是指文献所固有的,可找出某一或某些文献并将其从其他文献中识别出来的特征信息。
将某一文献的各种特征信息加以记载,成为一条文献记录,再将属于一定范围的全部文献记录按一定规则组织起来,就成为一个信息检索系统。
信息检索:
广义,信息存储与信息查找(两个过程);狭义:
仅指用户查找所需信息的过程。
用科学的方法,利用专门的工具,从大量的情报信息中查找到所需资料的过程。
存贮是检索的基础,检索是存贮的目的,只有有序地存储才能有效地检索。
检索四要素:
P:
患者人群;I:
干预措施、暴露因素;C:
对比;O:
结果。
检索的方法:
①追溯法 :
不利用一般的检索工具,而是利用已经掌握的文献末尾所列的参考文献,进行逐一地追溯查找“引文”的一种最简便的扩大信息来源的方法。
它还可以从查到的“引文”中再追溯查找“引文”,像滚雪球一样,依据文献间的引用关系,获得越来越多的相关文献。
②常用法:
顺查法、倒差法、抽查法。
③浏览法④综合法。
信息检索的类型(按检索对象):
文献检索、事实检索、数据检索
信息检索的原理:
检索者的检索特征标识=检索系统中的信息特征标识。
(关键:
检索标识与存贮标识的一致性)。
信息检索流程:
检索要求~检索语言~检索方法~检索工具~检索途径、检索标识~检索效率(反馈、评估)。
信息检索步骤:
分析检索课题;选择检索工具;确定检索方法;确定检索途径,形成检索标识;制定检索策略,查找文献线索;调整检索策略;获取原始文献。
信息检索效果:
检索过程中满足用户需求全面性和准确性的有效程度。
理想的检索效果:
无遗漏、无误差。
评价指标:
查全率=检出的相关信息数/系统中的相关信息数;查准率=检出的相关信息数/检出的信息总数。
检索者在检索时务必使自己的检索标识与信息系统中的文献特征标识达到一致或基本一致,方能检索出所需要的文献。
信息检索语言:
根据信息检索需要而创造的人工语言,描述信息特征及检索提问式的专门语言。
关键点:
满足信息存储的需要、满足信息检索的需要。
意义:
将杂乱无章的文献信息有序化,便于检索。
检索语言的类型:
1、按检索语言所标识的内容分:
外表特征检索语言、内容特征检索语言。
①描述文献信息外表特征的检索语言,包括:
题名,著者,出处,文献序号,引文,等等。
②描述文献信息内容特征的检索语言,包括:
号,主题词,关键词,代码。
2、根据检索语言是否规范化可分:
规范化检索语言、非规范化检索语言。
①规范化检索语言,包括:
主题词,分类号,分子式。
②非规范化检索语言,包括:
关键词,题名,著者……
分类检索语言的优缺点:
优点:
系统性强,族性检索,便于按学科、专业直接检索比较广泛的课题。
查全率较高。
缺点:
缺乏专指性,查准率不高,不能满足专深课题以及新兴学科、交叉学科和边缘学科知识的检索。
检索语言的应用原则:
在不同的环境,使用不同的检索语言①外部特征语言优先②主题词语言准确③关键词语言覆盖面广,包括最新进展的信息④通常使用多种检索语言,完成一项检索工作⑤结合不同任务的特点,可使用多种语言。
MeSH:
最权威、最常用的标引与检索的医学专业主题词表。
主要组成:
主题词变更表、字顺表、树状结构表、副主题词表。
主题词变更表:
每年略有增、删、替换、修改,反映医学科学的发展和进步,具有动态性;字顺表展示了主题词之间的横向关系;树状结构则揭示了主题词之间的纵向隶属关系。
作用①信息储存:
专指性,经过专业人员精心选择,代表专业水准②信息检索:
高效性。
特点:
①对医学文献中的自然语言进行规范化,使概念和主题词一致②保证文献的标引和检索过程在用词上的一致③可以对主题词进行扩检和缩检④具体动态性。
树状结构表作用①可从学科体系选择主题词②可帮助进行扩检或缩检③可帮助确定词的专业范围。
树状结构表与字顺表的关系:
他、①字顺表通过参照关系体现词间的横向关系,表现其灵活、专指、直接的主题法特性;树状结构表按学科体现词间的纵向学科等级隶属关系,表现其系统、稳定的分类特征②二者通过树状结构号相联系③二者配合使用,可保证标引与检索的准确性与全面性。
MeSH词的种类①叙词:
主题词,规范化的、揭示文献主题的,有检索意义的词/词组。
②入口词/款目词:
主题词的同(近)义词,不作标引及检索用,仅作为查找主题词的入口。
③文献类型主题词:
病例报告、对比研究、临床实验、综述等。
④地理位置主题词:
用以描述地理位置的词汇。
⑤特征词。
字顺:
将MeSH表所收主题词、入口词全部按字母顺序排列,并通过词下的主题范畴、注释、参照,揭示主题词所属范畴、词表中词与词间的关系,供选词使用。
MeSH的树状结构:
将MeSH表中的2万多个主题词按其所属学科范畴划分为15个大类:
解剖;有机体;疾病;化学品和药物分析;诊断;治疗;技术和设备;精神病学和心理学;生物科学;自然科学;人类学,教育,社会学和社会现象;工艺学、工业、农业;人文科学;情报科学;人群;卫生保健;地理名称。
关键词和标题词:
未经严格规范化处理的检索词或词组(自然语言)。
通常是从文献的题目、摘要、正文中选取出来。
揭示文献主要内容起关键性作用。
通常是由名词、形容词等实质性词构成。
关键词的优缺点:
优点:
自由选词,不受限制。
缺点:
同义词,近义词。
漏检。
主题词:
经过规范化处理的具有实质性意义的词或词组。
主题词的特点:
规范错综复杂的名词概念,对同义词、近义词、多义词进行规范和控制。
①主题词具有主题集中、学科分类的特点,故能提高文献检索的查全率和查准率。
②可组配副主题词提高检索的专指性。
③例子:
结核病/预防与控制。
规范:
是对一个概念的同义词、近义词和拼法变异词适当归并,采用参照系统,揭示相关语义,并有主题词的范畴表和树状结构表揭示相关族性。
主题词表:
①国内医学检索工具使用:
《中国中医药学主题词表》、《医学主题词注释字顺表》②国外医学检索工具:
MeSH,医学主题词表、
副主题词表:
将82个副主题词按字顺排列,表明其组配范围和组配规则。
检索工具:
用以报道、存储、查询信息知识的一切工具和设备。
也称检索系统。
检索工具的种类(信息检索系统的分类)1按收录范围划分①综合性检索工具:
收录并供检索多种学科或专业的文献信息。
②专业性检索工具:
收录并供检索某一学科或专业的文献信息。
③专题性检索工具:
只收录并供检索某一专题的文献信息。
2按载体形式划分①机读型检索工具:
检索数据库②网络检索工具:
搜索引擎3按著录内容划分①目录型检索工具②索引型检索工具③文摘型检索工具④全文型检索工具。
检索途径与检索标识的对应关系
检索途径检索标识示例
题名书名、刊名、文章篇名希氏内科学
著者著者姓名、机构名称SmithP
代号专刊号、登记号、报告号等US6207359
分类分类号R532.1
主题主题词、关键词等肺肿瘤/放射疗法
数据库定义:
相互关联的数据在计算机外存储器上有序的集合。
数据库是检索系统的信息源,也是用户检索的对象。
三个要点:
集合、数据、在电脑里
数据库结构:
①文档:
数据库中一部分记录的集合②记录:
构成数据库的基本信息单元。
③字段:
组成数据的记录项,用来描述文献的特征。
数据库类型:
文献型数据库、数据型数据库、事实型数据库、多媒体型数据库
常用的医学文献数据库:
中国生物医学文献数据库(CBM)二次文献;中国学术期刊全文数据库(CNKI)一次文献;重庆维普期刊全文数据库(VIP)一次文献;万方数据库(Wanfang)一次文献;美国生物医学文献数据库(PubMed)二次文献(英文)
检索信息的步骤:
①了解你想要什么信息:
学科、类型、年代、语种;②了解哪里可能有这样的信息:
因特网、图书馆的数据库、其它;③找出信息的检索词:
主题词、关键词、其它;④检索信息:
编写检索提问表达式,检索初步结果,调整检索策略,最终结果,下载信息。
检索提问表达式:
检索提问表达式=检索词+运算符。
检索词:
1.字词类2.数码类运算符:
布尔逻辑符:
AND、OR、NOT;字段限定符:
IN=[]截词符(通配符):
*?
#$;位置算符:
same、with、nea;其它检索技术:
加权检索、聚类检索等;逻辑“与”用AND或空格或*表示,表达概念间的交叉关系。
可以缩小检索范围,提高查准率。
逻辑“或”用OR或+表示,表达概念间的并列关系。
可以扩大检索范围,提高查全率。
逻辑“非”用NOT或-表示,表达概念间的不包含关系。
可以缩小检索范围,提高查准率。
逻辑运算顺序:
①当出现一个运算符时,从左至右。
如:
AANDBANDC。
②当一个检索式中同时使用了多种运算符时,优先运算顺序为:
()>NOT>AND>OR
检索结果的反馈调整
检出文献太多:
1、增加用AND连接的检索词,或用“二次检索”;2、用特定的副主题词进行检索;3、用字段限定检索;4、使用主要主题词进行加权检索,下位主题词检索或不扩展检索;5、进行文献类型、语种、重要核心期刊、年份的限定检索;6、用逻辑非NOT来排除无关检索词。
检出文献太少:
1、删除某些用AND连接的不重要检索词;2、增加用OR连接的检索词;3、位置运算符放宽;4、检索词后用截词符;5、多用几个副主题词,甚至选用所以副主题词;6、选用上位主题词扩检,或选用扩展全部树检索;7、同时用主题词和自由词检索,用OR连接;8、从在某个学科范围中输词检索改为在所以学科中输词检索;9、多用几种检索工具进行检索;
搜索引擎按其工作方式分三种:
1、全文搜索引擎Google\Baidu\AltaVista2、目录索引类搜索引擎Yahoo\Sohu\Sina\网易3、元搜索引擎(MetaSearchEngine)
Google学术搜索:
提供广泛学术文献,基本检索和高级检索
医学专业搜索引擎:
MedicalMatrix;MedicalWorldSearch(MWS,医学世界检索);HealthWeb卫生健康网;http:
//healthweb.org);Medscape;HealthAtoZ(临床医学);网上健康基金会(HON):
MedHunt、HONselect、HONmedia;Conference&Events;DailyNews;HONproject(HON项目):
HONdossie
PubMed数据库的特点1.全方位的链接:
①与期刊数据库、主题词表、专题子库等链接。
②与NCBI其它数据库的链接③检索结果显示链接,有全文、相关文献等链接。
2.收录文献广泛:
PubMed包括了MEDLINE数据库在内的13个数据库3.更新及时出版商以电子版形式向NLM提供已经或将要出版的文献书目,每天都在增添新的内容。
4.提供检索词自动转换功5.能在线获取部分免费电子版全文循证医学证据检索。
CochraneLibrary的数据库:
是医学保健领域系统评估的领先资源,研究了在某种医疗状况下为防治、治疗和康复而进行的干预的效果。
它们旨在帮助面临医疗保健问题的医生、患者、决策者和其他人士做出选择。
循证医学:
慎重、准确和明智地应用当前所能获得的最佳证据,结合临床医生个人专业和经验,考虑患者的价值观和愿望,制定出最佳诊疗措施。
询证医学与传统医学的区别:
1系统收集的证据优于非系统的临床观察2以患者终点结局为判效指标的试验优于仅根据生理学原理制定指标的试验3解释医学文献对医生是一项重要技能,有必要正规学习一些证据的相关通则,以达到熟练解释的程度4医生对于患者基于证据的个体化治疗优于仅靠专家意见作出的决策。
三要素:
①证据:
真实性、重要性、实用性。
②医生(doctor):
专业技术、临床经验。
③患者(patient):
价值观、愿望。
实践循证医学5步骤:
①提出问题:
病因、诱发因素、诊断、治疗、预后等;②查找证据:
各种数据库;③评价证据:
证据的类型,级别,真实性,重要性,实用性;④应用证据:
制定相应的诊疗方案;⑤总结提高:
做得好的方面;还可以做得更好的地方。
实践询证医学对医生的要求:
①丰富的临床经验和敏锐的临床判断能力,能提出问题;②计算机知识并能熟练检索医学文献;③应用临床流行病学和EBM知识严格评价文献。
批判性地阅读文献,能解释证据,特别是对证据的研究方法进行评价;④定量推理技能;⑤极好的交流技能、能提供病人所需的知识,提供病人能理解的最佳建议。
循证医学指导临床实践,通常采用“5A”法(5步法),即评价病人、提出临床问题、、采集最佳证据、评阅证据(Appraise)、应用于病人。
著名的询证医学数据库:
Cochrane图书馆、循证医学杂志、美国医师学会杂志俱乐部、循证护理杂志、循证卫生保健杂志、指南、国立指南库
证据的分类:
第1类证据:
系统评价和荟萃分析①系统评价:
采用减少偏倚和随即误差的原则和方法,筛选文献,进行合成,获得结论。
②荟萃分析:
这些文献是综合多个随机对照试验结果而得出的结论。
第2类证据:
随机对照试验:
随机对照试验所得的结果往往是更真实可靠的。
第3类证据:
临床实践指南:
为临床医生提供临床实践的指导性意见。
第4类证据:
卫生技术评估:
这种评估包括安全性评估、有效性评估、经济学评估、社会适应性评估等,为决策者提供决策参考。
证据的分级:
在循证医学实践中,查找证据的时候,需考虑:
你所找到的证据是属于哪一级的?
一级最好,属于金标准。
五级最不可靠,仅供参考。
Ⅴ级:
专家意见、个案报道、临床总结;Ⅳ:
无对照的病例系列报告;Ⅲ级:
有对照、无随机的试验;Ⅱ级:
单个随机对照实验;Ⅰ级:
系统评价,荟萃分析。
掌握证据评价技能,独立进行评价具体应注意以下几方面:
①设计是否真正的随机对照试验,是否应用盲法,组间主要临床特点基线状态的可比性,试验组或对照组除了接受各自的试验措施外,是否还接受了其它不同程度的辅助治疗等。
②诊断标准是否确切、可靠或公认,以评价疗效的真实性和代表性③纳入试验的全部对象是否完成了全部治疗。
④研究结果是否全部做了总结⑤治疗结果的临床意义及统计学意义。
⑥治疗对象特点的仔细描述。
⑦是否详细交待试验治疗的方法或措施。
Google的一般检索语法:
1.基本连接符:
①默认检索:
Google的默认连接符为AND;②逻辑“或”:
AORBORC;A|B;逻辑“非”:
AB-C;③固定短语检索:
“检索词。
2.其它Stopword:
http,.com,和,的不支持截词、不区分大小写
医学论文:
①特征:
创新性、科学性和准确性、学术性或理论性、规范性、逻辑性、可读性②种类:
1按科技文章的写作目的和作用一般可分为:
学术类,科技论文、学位论文(学士、硕士、博士学位论文)、科技报告(可行性、开题、进展、实验、考察)、专题研究、研究简报和快报、综述与评论。
2按科技论文发挥作用可分为:
理论型论文、技术型论文、学位论文。
3按研究的方式和论述的内容可分为:
实(试)验研究报告、理论推导、理论分析、设计计算、专题论述、综合论述③结构:
论点、论据、论证。
一般医学论文的基本格式:
前置部分:
引言(前言);正文:
临床资料(资料与方法)、结果、讨论;后置部分:
致谢、医学论文的参考文献。
医学文献的摘要:
目的、方法、结果、结论
参考文:
期刊、图书、专著中析出的文献、会议论文集、专利文献、学位论文
中文数据库:
《万方数据库》《中国期刊网》《维普中文科技期刊数据库》《国研报告》《中经专网》《中国资讯行》《中宏数据库》
国外医学文献检索工具:
美国的《医学索引》、荷兰的《医学文摘》、美国《生物学文摘》和美国《化学文摘》四大检索工具。
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