森林菌物分类学新进展.docx
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森林菌物分类学新进展
1.谈谈菌物在生物界的分类地位及其分类历史进展。
答:
目前所谓的菌物(Fungi)旧称真菌,是具有细胞核、没有叶绿体、借助于孢子进行有性和无性繁殖的异养生物(heterotrophic)。
其营养体通常是丝状、具有分支的管状结构,并多具有几丁质、少数具有纤维素、或几丁质与纤维素两种成分的细胞壁。
菌物在生物界的分类经过了一个漫长的阶段,1735年Linnaeus提出两界系统,菌物虽不能进行光合作用也无绿色,但有细胞壁就被列为了植物,细菌虽然能动但也因为其具细胞壁被列为植物。
Hogg(1861)Haeckel(1866)及中国学者邓叔群(1966)支持动物界、植物界、微生物界三界系统,因菌物不含叶绿素为异养型生物,这区别于其他植物所以将菌物分出,即生产者-植物、分解者-菌物、消费者-动物。
后来发展为四界系统Copeland,1938,1956;Whittaker,1959提出原生生物界、菌物界、植物界和动物界分类系统。
随着显微镜技术的发展,可把细胞分成两大类:
原核细胞和真核细胞。
原核细胞很小,其体积约为真核细胞的千分之一;原核细胞染色体为裸露DNA(即没有与蛋白质结合),其周围也没有膜与细胞其他部分隔开(即为原核),真核细胞染色体为DNA和蛋白质的结合物,且有核膜与细胞其他部分隔开(即为真核)。
这两大类细胞的差异,反映了生物进化的不同水平,所以Whittaker1969年又提出了五界分类系统:
原核生物界,包括细菌和其他原核生物;原生生物界,包括单细胞真核生物,如原生动物和多数藻类;菌物界;植物界;动物界。
这是应用最为广泛的分类系统,因它基本上反映了地球细胞生物的进化历程。
人们发现在五界分类系统中,原核界的细菌在形态上尽管很相似,但根据分子水平上的差异可明显分成两大类:
古细菌和真细菌,Cavalier-Smith认为,应把原核生物界分类两界:
古细菌界和真细菌界,就有了六界系统。
Cavalier-Smith,l988-l989又提出了八界分类系统即澡界、菌物、动物、植物、古真核生物、原生动物、古细菌、真细菌。
菌物(真菌)分类历史与进展
第一阶段:
比较形态学阶段(1729-1860)
主要依据肉眼可见的宏观形态鉴别真菌,分类简单。
Persoon,D.C.H.(1801)(荷兰)《SynopsisMethodicaFungorum》,《MycologiaEuropeae》2纲、6目;
Fries,E.M.(1821-1823)(瑞典人,“真菌学之林奈”)《SystemaMycologicum》4纲、16目。
第二阶段:
实验生物(细胞遗传)学阶段(1860-1960)
利用显微镜观察真菌细胞学、繁殖体结构,以进化论观点进行反映自然亲缘关系的分类。
DeBary(1866)(德)《MorphologieundPhysiologiederPilze》分真菌为4纲:
藻状菌纲、子囊菌纲、皮下菌(纲:
锈菌、黑粉菌)、担子菌纲;
GäumannE.A.(1926,1952)(瑞士)《Vergleichende(比较)MorphologiederPilze》4纲1类:
古生菌纲(Archimycetes)、藻状菌纲(Phycomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌类(ImperfectFungi);
MartinG.W.(1950,1961)(美)《OutlineoftheFungi》/BesseyE.A.,1950(美)《MorphologyandTaxonomyofFungi》3纲1类:
藻状菌纲(Phycomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌类;
邓叔群(1963)《中国的真菌》4纲1类:
粘菌纲(Myxomycetes)、藻状菌纲(Phycomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌类(ImperfectFungi);
AlexopoulosC.J.(1952)(美)《IntroductoryMycology》真菌门分4纲:
藻状菌纲(Phycomycetes:
单鞭毛菌亚纲、双鞭毛菌亚纲、无鞭毛菌亚纲)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌纲(Deuteromycetes);
AlexopoulosC.J.(1962)(美)《IntroductoryMycology》(2ed.)真菌亚门分9纲(成为现代真菌分类学基础):
根肿菌纲(Plasmodiophoromycetes)、壶菌纲(Chytridiomycetes)、丝壶菌纲(Hyphochytridiomycetes)、卵菌纲(Oomycetes)、接合菌纲(Zygomycetes)、毛菌纲(Trichomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌纲(Deuteromycetes)。
第三阶段:
超微结构与生物化学阶段(1960-1990)
利用电子显微镜观察真菌细胞超微结构、生物化学成分分析。
WhittakerR.H.(1969)(美)《Newconceptofkingdomoforganism》真菌独立为界(Fungi),分3亚界、8门:
裸菌亚界Acrosiomycota、Myxomycota、Labyrinthulomycota(网粘菌门)、双鞭毛菌亚界Oomycota、真菌亚界Chytridiomycota、Zygomycota、Ascomycota、Basodiomycota;
AinsworthG.C.(1973)(英)《TheFungi》(ⅣAB)真菌独立为界,其中的真菌门(Eumycota)分5亚门、18纲:
鞭毛菌亚门(Mastigomycotina)、Chytridiomycetes、Hyphochytridiomycetes、Plasmodiophoromycetes、Oomycetes;
AinsworthG.C.(1973)(英)《TheFungi》(ⅣAB)真菌独立为界,其中的真菌门(Eumycota)分5亚门、18纲:
接合菌亚门(Zygomycotina)、Zygomycetes、Trichomycetes、子囊菌亚门(Ascomycotina)、Hemiascomycetes、Plectomycetes、Pyrenomycetes、Loculomycetes、Laboulmycetes、Discomycetes;
AinsworthG.C.(1973)(英)《TheFungi》(ⅣAB)真菌独立为界,其中的真菌门(Eumycota)分5亚门、18纲:
担子菌亚门(Basidiomycotina)、Teliomyceres、Hynenomycetes、Gasteromyceres、半知菌亚门(Deuteromycotina)、Blastomycetes、Hyphomycetes、Coelomycetes;
HawksworthD.L.etal.(1983)《DictionaryoftheFungi》(7thed.)将真菌界(Fungi)分为:
2门18纲:
Myxomycota、Acrosiomycetes、Protosteliomycetes、Ceratiomyxomycetes、Dictyosteliomycetes、Myxomycetes、Plasmodiophoromycetes、Labyrinthulomycetes、Eumycota;
HawksworthD.L.etal.(1983)《DictionaryoftheFungi》(7thed.)将真菌界(Fungi)分为:
2门18纲:
Eumycota、Mastigomycotina、Chytridiomycetes、Hyphochytridiomycetes、Oomycetes、Zygomycotina、Zygomycetes、Trichomycetes、Ascomycotina、Noclassesrecognized、Basidiomycotina、Hynenomycetes、Gasteromyceres、Urediniomycetes、Ustilaginomycetes、Deuteromycotina、Hyphomycetes、Coelomycetes。
第四阶段:
分子系统学阶段(1990)
Barr(1992)菌物(Fungi)涉及3界8门:
PROTOZOA(Myxomycota、Plasmodiophoromycota)、
CHROMIST(Heterokonta、Oomycetes、Hyphochytridiomycetes、Labyrinthulea)、
EUMYCOTA(Chytridiomycota、Zygomycota、Ascomycota、Basidiomycota);
HawksworthD.L.etal.(1995)《DictionaryoftheFungi》(8thed.)菌物(Fungi)涉及3界11门:
原生动物界(Protozoa):
Acrosiomycota、Dictyosteliomycota、Myxomycota、Plasmodiophoromycota;
藻物界(Chromista):
Oomycota、Hyphochytridiomycota、Labyrinthulomycota;
真菌界(Fungi):
Chytridiomycota、Zygomycota、Ascomycota、Basodiomycota;
AlexopoulosC.J.etal.(1996)《IntroductoryMycology》(4thed.)菌物(Fungi)涉及3界11门:
原生动物界(Prototista):
Acrosiomycota、Dictyosteliomycota、Myxomycota、Plasmodiophoromycota;
异鞭毛生物界(Stramenoplia):
Oomycota、Hyphochytridiomycota、Labyrinthulomycota;
真菌界(Fungi):
Chytridiomycota、Zygomycota、Ascomycota、Basodiomycota;
Kirketal.(2008)《DictionaryoftheFungi》(10thed.)
界一:
原生动物界(Protozoa):
8门
界二:
藻物界(Chromista):
3门
界三:
真菌界(Fungi):
8门
Ascomycota、Basidiomycota、Blastocladiomycota(芽枝霉菌门)、Chytridiomycota、Glomeromycota(球囊霉菌门)、Neocallimastigomucota、Zygomycota。
3.评述接合菌真菌分类新进展
Alexopoulosetal.(1962,1979,1996)、Ainsworthetal.(1973)和Hawksworthetal.(1983,1995)都将接合菌门(Zygomycota)分为2纲,接合菌纲(Zygomycetes)和毛菌纲(Trichomycetes)。
其中接合菌纲的分类:
Ainsworthetal.(1973)的《TheFungi》将接合菌纲分为3个目:
Mucorales毛霉目(14fam.,Hesseltine&Ellis)Entomophthorales虫霉目(1fam.,WaterhouseG.M.)Zoopagales捕虫霉目(2fam.,DuddingtonC.L.)
Benjamin(1979)提出接合菌纲分为7个目:
毛霉目,虫霉目,捕虫霉目,Dimargaritales双珠霉目,Kickxellales梳霉目,Endogomales内囊霉目,钩孢毛菌目(具接合孢子)。
Benjamin(1996)以及Hawksworthetal.(1995)将接合菌纲7个目重新调整,除钩孢毛菌目归毛菌纲外,内囊霉目仅留外生菌根,将内生菌根归入Glomales球囊霉目,其他五个目没有变化。
Kirketal.(2001)《DictionaryoftheFungi》(第九版)则将接合菌纲调整为10个目分别为:
Basidiobolales粪蛙霉目(1fam.),(1fam.)双珠霉目,内囊霉目(1fam.),虫霉目(5fam.),Geosiphonales(1fam.)地管衣目,球囊霉目(5fam.),梳霉目(1fam.),Mortierellales(1fam.被孢霉目),毛霉目(12fam.),捕虫霉目(5fam.)
Whiteetal.(2006)将接合菌门分为九个目,内孢毛菌目,双株霉目,内囊霉目,虫霉目,钩孢毛菌目,梳霉目,Mortierellales被孢霉目,毛霉目和捕虫霉目。
其中内孢毛菌目和钩孢毛菌目属毛菌纲。
在Whiteetal.(2006)研究基础上,Hibbettetal.(2007)、Kirketal.(2008)将接合菌门直接分为4亚纲、10目。
并取消毛菌纲,将其两个目(钩孢毛菌和内孢毛菌目)归入接合菌,另两目(变形毛菌目和外毛菌目)归原生动物界,球囊霉目升为门。
毛霉目在接合菌纲中含有的种类最多,属腐生菌,许多是工业真菌。
少数寄生于其他真菌上,极少数引起植物病害,也能引起人类病害。
主要依据无性繁殖孢子囊结构类型,其次是生活习性及其有性生殖特点进行分类。
BennyandBenjamin(1993)将毛霉目分为14科,Alexopoulosetal.(1996)《IntroductoryMycology》(4thed.)也选择了这一分类系统;Hawksworthetal.(1995)将毛霉目分为13科;Kirketal.(2008)在《DictionaryoftheFungi》(第十版)对毛霉目分科做了较大调整。
将3科回归毛霉科或笄霉科。
被孢霉科Mortierellaceae升为单科目,并以其中的Umbelopsis伞状霉属为基础,新建Umbelopsidaceae伞状霉科。
6白粉菌在子囊菌门的分类地位及科属变化
白粉菌是广泛分布的一类重要的植物专性寄生性真菌,可侵染多种被子植物对农作物、果树等危害较大。
(1)形态为主的分类阶段
科、属、种的变化:
Tulasne(1861)第一次正式提出关于白粉菌科Erysiphaceae的相关内容,Lindau(1897)将白粉菌科Erysiphaceae、暗绒菌科Perisporiaceae和小盾壳科Microthyriaceae归入暗绒菌目Perisporiales,Saccardo(1882)根据Perisporiales目中PerisporiumgramineumFr.缺乏无性型所以被归入了半知菌,据此Gwynne&Barnes(1927)提出用白粉菌目Erysiphales代替暗绒菌目Perisporiales。
Martin(1945)在白粉菌目Erysiphales内只留下白粉菌科Erysiphaceae,将其余的科全部转移到其他目内。
Miller(1941,1949)将其归入不整囊菌纲Plectomycetes,他认为白粉菌目Erysiphales还包括白粉菌科Erysiphaceae、暗绒菌科Perisporiaceae和长喙壳科Ceratostomataceae。
Luttrell(1951)较为详细的讨论了关于白粉菌科Erysiphaceae的分类,根据白粉菌目Erysiphales的子囊排列有一定的规律,子囊在成熟后不消解的特征,他认为应该将其归入核菌纲Pyrenomycetes白粉菌目Erysiphales下分为小煤炱菌科Meliolaceae与白粉菌科Erysiphaceae。
之后大多数学者认为所有白粉菌应纳入一个科,即白粉菌科Erysiphaceae(Ainsworthetal.1973、Braun1987,1995,2012、Junell1967、Hawksworthetal.1995、Nomura1997、Shin2000、Kirketal.2008、郑儒永1987)。
Homma(1937)在白粉菌科下分了三个亚科:
白粉菌亚科Erysipheae、球针壳亚科Phyllactineae和内丝白粉菌亚科Leveilluleae。
Braun(1981)将其合并为两个亚科:
白粉菌亚科Erysiphoideae、球针壳亚科Phyllactinioideae。
此外,Katumoto(1973)根据子囊果有两层可以互相脱离的特性而建立了离壁壳亚科Cystothecoideae。
法国人deCandolle(1805)年第一个建立了白粉菌属ErysipheHedwigf.,这个属当时包括了现在已知至少为6个属的许多个种(戴芳澜1979、郑儒永等1987、Braun1987)。
白粉菌无性型最早的属名为粉孢属Oidium(Link1824)。
白粉菌属级分类一直是非常有争议的问题,传统的白粉菌科Erysiphaceae内属的划分主要是以有性阶段的子囊果的附属丝形态、子囊的数目为标准。
法国人Léveillé(1851)将白粉菌科Erysiphaceae先后分为六个属。
单子囊组2个属:
叉丝单囊壳属PodosphaeraKunze.和单囊壳属SphaerothecaLév.,多子囊组4个属:
球针壳属PhyllactinilaLév.、钩丝壳属UncinulaLév.、白粉菌属ErysipheHedw和叉丝壳属MicrosphaeraLév.。
随后,Berkeley&Curtis(1860)根据子囊果内外两层壁相互分离的特点,建立了新属离壁壳属CystothecaBerk.&Curtis,为多数学者承认(Homma1937、Blumer1967、Braun1981、郑儒永1987)。
白粉菌的第二个无性型属是拟小卵孢属OvulariopsisPat.&Har.(1900),该属的主要特点是菌丝体半内生,分生孢子单生。
无性型第三个属是拟粉孢属OidiopsisScalia(1902),该属与OvulariopsisPat.&Har.的主要区别是分生孢子梗自内生菌丝上形成后从气孔穿出并常分枝。
叉钩丝壳属SawadaiaMiyabe是由日本人Miyake(1914)根据附属丝具有叉钩状的特点从钩丝壳属Uncinula分出。
内丝白粉菌属LeveilluaArn.菌丝部分内生于寄主体内,因此将其从白粉菌属Erysiphe分出(Arnaud1921)。
Hirata(1966)认为白粉菌科至少有18个属。
Yarwood(1973)承认包括Oidium在内的8个白粉菌属:
Erysiphe、Microsphaera、Uncinula、Sphaerotheca、Podosphaera、Leveillua、Phyllactinila和顶孢属Arosporium(≡Oidium)。
无性型第四个属是旋梗孢属StreptopodiumZheng&Chen(1978),该属与OvulariopsisPat.&Har.的主要区别是分生孢子梗基部的旋扭数不同。
郑儒永(1985)认为白粉菌应分为19个属、郑儒永和余永年(1987)对我国白粉菌进行研究后提出了白粉菌属级分类系统,共22个属,其中包括有性属18个,无性属4个,Braun(1987)承认了郑儒永的大部分属,但他不承认顶叉钩丝壳Furcouncinula和束丝壳Trichocladia,而把它们分别作为钩丝壳Uncinula和叉丝壳Microsphaera的异名(Braun1987,1995)。
Braun(1987)世界范围的白粉菌专著《AmonogrsphoftheErysiphales(powderymildews)》中描述了22个属,其中包括18个有性属,4个无性属。
近百年来,对于种的划分有以下二种倾向:
最早Salmon(1900)提出了依据形态来分类,子囊孢子与子囊的数目形态是这个系统分类中最重要的依据,对其它形态特征都不够重视而且他并没有意识到无性型在白粉菌分类中的价值。
以Blumer(1967)为代表的系统,是目前世界上应用最普遍的系统,主要以白粉菌的形态为主并且把寄主专化性也考虑在其中,是一个比较合理的分类系统、我国白粉菌研究学者也都采用此分类系统(郑儒永等1987),他们认为白粉菌是绝对寄生菌,所以必须考虑它们的寄主专化性,划分种时以形态为依据,形态为基础结合考虑寄主专化性,他们共记载了中国白粉菌253种、Braun(1987)把形态特征作为划分种的重要基础,认为白粉菌科的大部分属和组中的种是具有寄生专化性的,有或多或少狭窄的寄主范围,不超越一个寄主科的界限,有时甚至更窄,经常是一个属的仅有的几个种,虽然还有争议但是这个系统是目前世界上应用最为普遍的。
Braun(1987,1995)保留了一些形态特征有不同的复合种,然而这些菌有较为广的寄主范围,对于Golovinomyces和Leveillula属多寄主的复合种往往在形态上是很难辨认的。
寄生在同科寄主上稍有形态差异,并有地理分布差异的通常为变种,对于更小的形态差异用变型,他在《TaxonomicmanualoftheErysiphales(powderymildews)》中记载全世界白粉菌868种。
(2)分子为主的分类阶段
科、属、种的变化:
Sugiyamaetal.(1999)利用18SrDNA序列对散囊菌onygenaleanfungi做了研究,推出锤舌菌目Leotiales与白粉菌目Erysiphales有很近的亲缘关系,Braun(1987,1995)、Morietal.(2000a,b)和Takamatsu(2004)详细讨论了白粉菌的分类地位,认为其应该是单独的一个科,既不属于不整囊菌纲Plectomycetes也不属于核菌纲Pyrenomycetes,由于与锤舌菌目Leotiales有密切的关系,Kirketal.(2008)在《DictionaryoftheFungi,10thed.》中将白粉菌目Erysiphales划分到子囊菌门Ascomycota、锤舌菌纲Leotiomycetes、锤舌菌亚纲Leotiomycetidae内,白粉菌目Erysiphales只含有一个白粉菌科Erysiphaceae。
Braun(2012)《TaxonomicmanualoftheErysiphales(powderymildews)》也采用这个分科系统。
扫描电镜技术的应用为白粉菌的无性型的鉴定提供了更准确可靠方法,Cooketal.(1997)利用扫描电镜技术观察孢子纹饰更为精细,使分类更趋向自然特别是对白粉菌分生孢子超微结构进行了观察,发现不同属的分生孢子的外壁和端壁具有不同的纹饰,这对白粉菌属的分类具有非常重要的价值。
据此他们在粉孢属Oidium下建立了8个亚属,To-anunetal.(2005)根据rDNA序列建立了一
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