医学图像格式转换及读取与显示.docx
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医学图像格式转换及读取与显示.docx
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医学图像格式转换及读取与显示
1.医学图像格式转换
通常从机器拷贝出来的医学图像数据为DICOM格式,如果是多种模态图像混合,则需要使用Dcm2AsiszImg.exe工具把多模态图像分类出来,软件如下图所示:
Dcm2AsiszImg是一个接收、发送DICOM图像、把DICOM图像进行分类、
把DICOM转化为安科Img图像格式的软件工具。
用法:
“输出目录”选择待转化的图像保存路径,“DICOM图像分类”选择要转化的原始图像目录,最后点击“DICOM图像分类”,输出图像分辨率为256*256。
常用的图像格式还有ANALYZE和NIFTI,ANALYZE格式的图像包括图像文件.img和头文件.hdr,应用于SPM2。
NIFTI把图像文件和头文件合并为.nii文件,应用于SPM8、FSL、FreeSurfer等。
可以利用MRICron软件的dcm2niigui.exe插件把DICOM格式转化为ANALYAZE和NIFTI格式。
在Help下的preference处可设置输出参数:
2.读取与显示DICOM图像
Matlab提供了dicominfo、dicomdict、dicomdisp、dicomread、dicomuid、dicomwrite函数,可实现DICOM格式图像的读取、显示、保存等操作,以及查看扫描信息。
3.读取与显示NIFTI格式图像
MRIcro软件可以显示NIFTI图像
①NIfTI这个Matlab程序可以读取显示、保存、制作核磁共振图像。
具体如下:
>>[hdr,filetype,fileprefix,machine]=load_nii_hdr('output.hdr');
>>[img,hdr]=load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine);
>>save_nii(nii,filename,[old_RGB]);
②SPM方法:
helpspm_read_vols
V=spm_vol_nifti('output.hdr')
[Y,XYZ]=spm_read_vols(V);
4.Freesurfer的mgh图像读取与显示
Freesurfer安装目录下有一个matlab程序包,提供了load_mgh,save_mgh等函数实现该文件的读取与显示。
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