教学大纲生物化学与分子生物学临床医学药学临床药学专业72学时版.docx
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教学大纲生物化学与分子生物学临床医学药学临床药学专业72学时版
广东药学院
教学大纲
课程名称生物化学与分子生物学
适用专业药学专业
临床医学专业
临床药学专业
生物化学与分子生物学系
2013年9月
一、课程性质、目的和任务
生物化学与分子生物学(biochemistryandmolecularbiology)是研究生命化学的科学,它是在分子水平探讨生命的本质的一门基础学科,其主要研究生物体的分子结构与功能、物质代谢与代谢调节及其在生命活动中的作用。
本课程主要是介绍生物化学与分子生物学的基本知识,以及某些与医药学相关的生物化学与分子生物学的进展,包括生物大分子的结构与功能,物质代谢及其调节,基因信息的传递以及其他一些相关的专题知识,为学生学习其他基础课、专业课乃至毕业后的继续教育、相关学科的研究工作中在分子水平上探讨疾病的病因、发病机理及疾病诊断、预防、治疗奠定理论与实验基础。
二、课程基本要求
本课程分为掌握、熟悉、了解三种层次要求。
掌握的内容要求理解透彻,能在本学科和相关学科的学习工作中熟练、灵活运用其基本理论和基本概念。
熟悉的内容要求能熟知其相关内容的概念及有关理论,并能适当应用。
了解的内容要求对其中的概念和相关内容有所了解。
考试内容中掌握的内容约占70%,熟悉、了解的内容约占30%,超大纲内容不超5%。
本大纲的参考教材是“十二五”普通高等教育本科国家级规划教材、卫生部“十二五”规划教材、全国高等医药教材建设研究会“十二五”规划教材《生物化学与分子生物学(第8版)》(周爱儒主编,北京,人民卫生出版社,2013年3月第8版)。
三、课程基本内容及学时分配
生物化学与分子生物学课程的教学内容大体分为四个部分:
第一部分主要讨论生物大分子的结构和功能;第二部分主要探讨物质代谢、能量代谢及代谢调节等相关内容;第三部分主要探讨分子生物学中遗传信息的传递等相关内容,主要涉及DNA、RNA、蛋白质的生物合成及其调控等;第四部分为专题内容,主要探讨常用分子生物学技术、基因重组技术、癌基因与抑癌基因、基因诊断与基因治疗等分子生物学相关内容。
本课程药学专业总学时108学时,其中理论课72学时,实验课36学时;临床医学专业、临床药学专业总学时99学时,其中理论72学时,实验27学时。
理论课大纲中的图示说明:
下划线“”为掌握的内容;下划线“”为熟悉的内容;没有划线的为了解的内容。
绪论(1学时)
一、生物化学与分子生物学的概念。
二、生物化学与分子生物学发展简史:
叙述生物化学阶段,动态生物化学阶段,分子生物学时期。
三、生物化学研究的主要内容:
生物分子的结构与功能,物质代谢与调节,基因信息传递及其调控。
四、生物化学与医学、药学的关系。
第一篇生物分子结构与功能
第一章蛋白质的结构与功能(5学时)
一、蛋白质的元素组成及元素组成特点:
蛋白质平均含氮量为16%。
二、蛋白质组成的基本单位——氨基酸:
氨基酸的结构通式;氨基酸的分类;氨基酸的三字符号,一字符号,等电点;氨基酸的理化性质。
三、氨基酸的连接:
肽键;肽;多肽链;N末端和C末端;多肽链的方向性;氨基酸残基,蛋白质。
四、重要的活性多肽:
谷胱甘肽的结构与功能;多肽类激素和神经肽的结构与功能。
五、蛋白质的分子结构:
1.蛋白质的一级结构:
定义、结构特点;2.蛋白质的二级结构:
定义;肽单元;二级结构的主要类型及结构特点;超二级结构及模体;3.蛋白质的三级结构:
定义、稳定力、结构域;4.蛋白质的四级结构:
定义、稳定力。
六、蛋白质的分类。
七、蛋白质结构与功能的关系:
蛋白质一级结构与功能的关系;蛋白质空间结构与功能的关系。
八、蛋白质的理化性质:
蛋白质的两性电离性质;蛋白质的胶体性质;蛋白质变性与复性;蛋白质的紫外吸收;蛋白质的呈色反应。
九、蛋白质的分离与纯化与结构分析。
第二章核酸的结构与功能(5学时)
一、核苷酸是核酸的基本组成单位:
碱基、核糖、脱氧核糖、核苷、脱氧核苷、核苷酸、脱氧核苷酸的结构。
二、核酸的一级结构:
核苷酸的连接方式:
3’,5’-磷酸二酯键;核酸链的方向性;核酸一级结构的定义;一级结构的书写方式。
三、DNA的二级结构:
B型DNA的结构特点;DNA二级结构的多样性。
四、DNA的超螺旋结构及其在染色质中的组装。
五、DNA的功能:
DNA是遗传信息的物质基础。
六、RNA的种类及功能。
七、信使RNA的结构与功能。
八、转运RNA的结构与功能。
九、核蛋白体RNA的结构与功能。
十、核酸的理化性质:
核酸的紫外吸收;核酸的变性与复性;核酸的分子杂交。
十一、核酸酶的概念、分类、功能。
第三章酶(6学时)
一、酶概念。
二、酶的分子组成:
单纯酶,结合酶的概念;全酶、酶蛋白、辅助因子的概念;金属离子的功能;辅酶或辅基的概念及功能;B族维生素与辅酶的关系。
三、酶的活性中心:
定义;必需基团、结合基团、催化基团、活性中心外的必需基团的概念和功能。
四、同工酶:
概念,生理意义,医学应用。
五、酶促反应的特点:
高效性,特异性,可调节性,不稳定性。
六、酶促反应的机制:
能显著降低反应活化能。
七、酶催化反应的化学原理:
诱导契合学说;中间复合物学说;酶催化反应的一些化学机制。
八、酶促反应动力学:
1.底物浓度对反应速度的影响:
米氏方程式、Km与Vm的意义;2.酶浓度对反应速度的影响;3.温度对反应速度的影响;4.pH对反应速度的影响;5.抑制剂对反应速度的影响:
不可逆性抑制作用、可逆性抑制作用的概念。
可逆性抑制作用:
竞争性抑制的定义、对Km和Vm的影响;非竞争性抑制的定义、对Km和Vm的影响;反竞争性抑制的定义、对Km和Vm的影响;酶竞争性抑制在医学上的应用:
磺胺类药物的作用机理。
6.激活剂对反应速度的影响。
九、酶的调节:
1.酶的别构调节;2.酶的共价修饰调节;3.酶原与酶原的激活;4.酶含量的调节。
十、酶的分类与命名。
十一、酶与医药学的关系。
第四章聚糖的结构与功能【自学】
一、聚糖的概念及主要类型。
二、糖蛋白的分子结构及对蛋白质半衰期、结构与功能的影响。
三、蛋白聚糖的分子结构及功能。
四、糖脂的分子结构及功能。
五、聚糖结构蕴含的生物信息。
第五章维生素与矿物质【自学】
一、维生素的概念及其分类。
二、脂溶性维生素:
分类;各种脂溶性维生素的化学结构特点,活性形式,生物学功能。
三、水溶性维生素:
分类;各种水溶性维生素的化学结构特点,活性形式,生物学功能。
四、微量元素:
概念;常见微量元素的生物学功能。
第二篇物质代谢及其调节
第六章糖代谢(6学时)
一、糖的生理功能;糖的消化、吸收与转运;糖代谢的概况。
二、糖的无氧氧化:
1.糖无氧氧化(糖酵解)的定义;2.糖无氧氧化的基本过程:
糖酵解反应过程中ATP的生成和关键酶;3.糖酵解的调节;4.糖酵解的生理意义;5.其他单糖的代谢。
三、糖的有氧氧化:
定义,基本过程,糖有氧氧化的生理意义,生成ATP数量的计算,有氧氧化的调节,巴斯德效应。
四、三羧酸循环:
定义,详细过程,关键酶及脱氢辅酶,三羧酸循环的特点及生理意义。
五、磷酸戊糖途径:
定义,基本过程,关键酶,磷酸戊糖途径的调节,磷酸戊糖途径的生理意义。
六、糖原的合成与分解:
定义,基本过程,关键酶,糖原合成与分解的调节。
七、糖异生途径:
1.糖异生途径:
定义,基本过程,关键酶,糖异生的调节,糖异生的生理意义;2.乳酸循环:
定义,基本过程,生理意义;3.葡萄糖的其他代谢途径:
葡萄糖醛酸途径,多元醇途径,2,3-二磷酸甘油酸旁路。
八、血糖及其调节:
1.血糖的来源和去路;2.血糖水平的激素调节:
胰岛素作用的机理,胰高血糖素的作用机理;3.血糖水平异常。
第七章脂质代谢(4学时)
一、脂质的化学:
脂质的概念,分类,化学结构及主要功能,必需脂肪酸。
二、脂质的消化、吸收。
三、甘油三脂代谢:
1.甘油三脂的合成代谢:
合成原料来源,基本过程,关键酶;2.甘油三酯的分解代谢:
(1)脂肪的动员;
(2)甘油分解代谢的基本过程;(3)脂肪酸分解的基本过程:
脂肪酸的激活,肉碱的穿梭作用,β-氧化的基本过程;(4)饱和脂肪酸氧化过程中ATP生成数量的计算;(5)酮体的生成与利用:
酮体的定义,代谢的基本过程,代谢特点,关键酶,生理意义。
四、磷脂的代谢:
1.甘油磷脂的代谢:
甘油磷脂的组成、分类及结构;甘油磷脂的合成及降解。
2.鞘磷脂的代谢:
鞘磷脂的化学组成及结构;鞘磷脂的代谢。
五、胆固醇代谢:
1.胆固醇的合成:
合成部位,合成原料,合成的基本过程,关键酶,合成的调节;2.胆固醇的转化。
六、血浆脂蛋白代谢:
1.血脂的概念;2.血浆脂蛋白的分类、组成及结构;3.载脂蛋白的定义和功能;4.血浆脂蛋白代谢:
血浆脂蛋白代谢过程,血浆脂蛋白的主要功能;5.血浆脂蛋白代谢异常。
第八章生物氧化(4学时)
一、生物氧化的概念及特点。
二、呼吸链:
呼吸链的概念;呼吸链中各成员的结构与功能;呼吸链的组成:
NADH和FADH2这两条重要呼吸链的排列顺序。
三、氧化磷酸化和底物水平磷酸化:
1.氧化磷酸化和底物水平磷酸化的概念;磷氧比值;氧化磷酸化的偶联部位;2.氧化磷酸化偶联机制:
化学渗透假说;3.ATP合酶的结构与作用机理;4.ATP在能量代谢中的核心作用:
高能键、高能化合物的概念;ATP的生成、储存和利用。
四、影响氧化磷酸化的因素:
体内能量状态对氧化磷酸化的调节作用;常见抑制剂的抑制作用;甲状腺素的调节作用;线粒体DNA突变对氧化磷酸化的影响。
五、通过线粒体内膜的物质转运:
胞浆中NADH的氧化:
α-磷酸甘油穿梭和苹果酸-天冬氨酸穿梭作用的生理意义;腺苷酸转运蛋白;线粒体蛋白质的跨膜转运。
六、其他氧化与抗氧化体系。
第九章氨基酸代谢(4学时)
一、蛋白质的生理功能。
二、蛋白质的营养价值:
1.机体蛋白质营养状况的评价:
氮平衡;2.食物蛋白质营养价值评价:
蛋白质的总量及必需氨基酸的种类和比例。
三、蛋白质的消化、吸收与腐败作用。
四、氨基酸的一般代谢:
1.体内蛋白质的降解;2.体内氨基酸代谢概况;3.氨基酸的脱氨基作用:
(1)转氨基作用:
定义,反应通式,维生素B6的作用,生理意义;
(2)L-谷氨酸氧化脱氨基作用:
定义,反应式,生理意义;(3)联合脱氨基作用:
定义,主要方式,基本过程,生理意义;(4)氨基酸的其他脱氨基方式。
4.α-酮酸的代谢。
五、氨的代谢:
1.血氨的来源;2.氨的转运:
丙氨酸-葡萄糖循环;谷氨酰胺的运氨作用;3.尿素的生成:
(1)尿素循环的定义;
(2)尿素的合成:
合成的基本过程,关键酶,尿素循环的特点;(3)尿素合成的调节;(4)高血氨症和氨中毒。
六、个别氨基酸的代谢:
1.氨基酸脱羧基作用:
生理活性物质的生成和作用;2.一碳单位的代谢:
概念,载体,一碳单位的来源和互变,生理意义;3.含硫氨基酸的代谢:
甲硫氨酸循环;4.芳香族氨基酸的代谢。
5.支链氨基酸的代谢。
第十章核苷酸代谢(3学时)
一、核苷酸的消化、吸收。
二、核苷酸的生物功能。
三、嘌呤核苷酸的合成代谢:
1.从头合成途径:
概念,原料的来源;2.补救途径:
概念,反应过程;3.脱氧核苷酸的生成;4.嘌呤核苷酸抗代谢物。
四、嘌呤核苷酸的分解代谢:
分解的基本过程;分解终产物:
尿酸。
五、嘧啶核苷酸的合成代谢:
1.从头合成途径:
概念,原料的来源;2.补救途径:
概念,反应的基本过程;3.嘧啶核苷酸抗代谢物。
六、嘧啶核苷酸的分解代谢:
分解的基本过程,分解终产物。
第十一章非营养物质代谢(4学时)
一、生物转化作用:
非营养物质的概念;生物转化作用的概念、意义;生物转化作用不等于解毒作用;生物转化的两相反应:
第一相反应、第二相反应的概念及其主要反应方式;生物转化作用的影响因素。
二、胆汁与胆汁酸的代谢:
1.胆汁的概念,主要成分;2.胆汁酸的分类:
(1)游离型胆汁酸与结合型胆汁酸;
(2)初级胆汁酸与次级胆汁酸;3.胆汁酸的主要生理功能;4.胆汁酸的代谢及胆汁酸的肠肝循环。
三、血红素的生物合成:
原料,场所,反应基本过程,关键酶,血红素合成的调节。
四、胆色素的代谢与黄疸:
胆色素的概念,来源;胆红素生成;结合胆红素的生成与运输;高血红素血症、黄疸的概念。
第十二章物质代谢的整合与调节【自学】
一、物质代谢的特点。
二、物质代谢的相互关系:
各种能量物质的代谢相互联系相互制约;糖、脂和蛋白质代谢通过中间代谢物而相互联系。
三、组织、器官的代谢特点及联系。
四、物质代谢调节:
1.细胞水平的代谢调节:
细胞内酶的隔离分布;关键酶的概念;关键酶的变构调节及变构调节的特点;酶的化学修饰调节及其调节特点;酶量的调节。
2.激素水平的代谢调节。
3.整体调节。
第四篇遗传信息的传递
第十三章真核基因与基因组(2学时)
一、基因、基因组的概念。
二、真核基因的结构与功能:
1.真核基因的基本结构与功能;2.断裂基因的概念;3.调控序列在基因中的作用及一些重要的调控序列及其功能。
三、真核基因组的结构与功能:
真核基因组结构的特点;重复序列、多基因家族、假基因等的概念;真核基因组的功能。
四、线粒体DNA结构特点。
五、人的基因在染色体上的分布特征。
第十四章DNA的生物合成(4学时)
一、遗传学的中心学法则。
二、复制的基本规律:
1.半保留复制:
概念,生物学意义。
2.双向复制:
概念;复制起始点、复制叉、复制子的概念。
3.复制的半不连续性:
概念;领头链、随从链、冈崎片段的概念;4.DNA的合成方向。
三、DNA复制的酶学和拓扑学变化:
1.复制的化学反应:
合成DNA的基本条件;2.DNA聚合酶:
原核生物DNA聚合酶的主要类型,结构及功能;真核生物DNA聚合酶的主要类型及功能;3.复制保真性的酶学依据;4.复制中的解链和DNA分子拓扑学变化:
解螺旋酶、单链DNA结合蛋白、引物酶、拓扑异构酶I、拓扑异构酶II的功能;5.DNA连接酶:
功能。
四、DNA生物合成过程:
1.原核生物的DNA生物合成:
基本过程;2.真核生物的DNA生物合成:
基本过程。
端粒的概念,组成,作用原理,生物学意义。
五、逆转录和其他复制方式:
1.逆转录病毒和逆转录酶:
逆转录的概念;2.逆转录研究的意义;3.滚环复制和D环复制。
第十五章DNA损伤与修复(1学时)
一、DNA损伤:
DNA损伤、突变的概念;引发突变的因素;DNA损伤的主要类型。
二、DNA损伤的修复:
DNA损伤修复的主要类型及其机制。
三、DNA损伤和修复的意义。
第十六章RNA的生物合成(3学时)
一、转录的概念;转录和复制的异同点。
二、原核生物转录的模板与酶:
1.不对称转录、结构基因、模板链、编码链的概念;模板链、编码链、转录产物、蛋白质肽链间的关系。
2.原核RNA聚合酶:
RNA聚合酶的结构及各亚基的功能。
3.模板与酶的辨认结合:
启动子的概念。
三、原核生物转录过程:
基本过程。
四、真核生物的转录过程:
真核生物RNA聚合酶的分类及功能;转录因子的概念及其功能;转录过程的一些特点。
五、真核生物转录后加工:
1.mRNA转录后加工:
添加“帽子”、“尾巴”结构;断裂基因的剪接;mRNA编辑:
概念,生物学意义。
2.rRNA的转录后加工:
剪切;与蛋白质装配为核糖体。
3.tRNA的转录后加工:
添加“氨基酸臂”;核苷酸的修饰;剪切和剪接。
六、RNA催化的自剪接作用。
七、RNA在细胞内的降解。
第十七章蛋白质的生物合成(4学时)
一、蛋白质生物合成体系的组成。
二、mRNA在蛋白质合成中的作用:
mRNA是蛋白质生物合成的信息模板。
遗传密码子的概念;密码子的特点:
方向性、连续性、简并性、摆动性、通用性。
起始密码子,终止密码子,开放阅读框的概念。
三、tRNA在蛋白质合成中的作用:
tRNA是蛋白质合成时氨基酸的运载工具。
四、核糖体在蛋白质合成中的作用:
核糖体是蛋白质生物合成的场所。
核蛋白体的基本结构。
五、蛋白质生物合成需要的酶类和蛋白质因子。
六、氨基酸与tRNA的连接:
氨基酰-tRNA合成酶的功能及翻译的保真性;特殊的起始氨基酰-tRNA:
结构与功能。
七、蛋白质生物合成过程:
蛋白质生物合成的基本过程。
八、蛋白质合成后加工和输送:
1.多肽链折叠为天然功能构象的蛋白质:
分子伴侣的功能;2.一级结构的修饰:
肽链N-端和C-端的切除和化学修饰;氨基酸残基的化学修饰;水解加工生成活性蛋白质或多肽;3.空间结构的修饰:
亚基的聚合;辅基的连接;4.蛋白质合成后的靶向输送:
信号序列的作用;分泌型蛋白分泌蛋白质的基本过程。
九、蛋白质生物合成的干扰和抑制:
1.抗生素类抑制蛋白质的合成的机理;2.其他干扰蛋白质合成的物质的作用机理。
第十八章基因表达调控(3学时)
一、基因表达调控基本概念与特点:
1.基因表达的概念;2.基因表达的特点;3.基因表达的方式;4.顺式作用元件、反式作用因子的概念及作用;5.基因表达调控的多层次和复杂性;6.基因表达调控的生物学意义。
二、原核基因表达调节:
1.操纵子的概念及作用机制;2.乳糖操纵子调节机制。
3.色氨酸操纵子调节机制;4.转录终止阶段的调控机制;5.翻译水平的调控机制。
三、真核基因表达调节:
1.真核基因表达调控特点;2.染色质结构与基因表达调控的关系;3.顺式作用元件的主要类型及其作用;4.反式作用因子主要类型及其作用;5.转录因子常见的结构域及其作用;6.转录起始复合物调控转录的机制;7.转录后水平的调控机制;8.翻译水平的调控机制。
第十九章细胞信号转导的分子机制(4学时)
一、细胞信号转导的概念。
二、细胞信号转导概述:
1.细胞信号(配体)的概念、分类、作用机制;2.受体的概念、作用机制及与配体相互作用的特点;3.胞内信号转导的多通路性及网络性。
三、细胞内信号转导分子:
1.信号转导分子的概念、分类及一般作用机制;2.第二信使的概念、主要类型及其作用;3.酶在信号转导中的作用;4.信号转导蛋白在信号转导中的作用。
四、细胞受体介导的细胞内信号转导:
1.细胞内受体信号转导机制;2.离子通道信号转导机制;3.G蛋白偶联受体介导的细胞信号转导:
(1)G蛋白偶联受体的结构与功能;
(2)G蛋白的概念、分类、作用机制;(3)几种常见的信号转导通路:
cAMP-PKA通路、IP3/PKC通路、Ca2+/钙调蛋白依赖的蛋白激酶通路;4.酶偶联受体介导的信号转导:
(1)基本模式;
(2)几种常见的信号转导通路:
MAPKK通路、JAK-STAT通路、Smad通路、PI-3K通路、NF-kB通路。
五、信号转导的基本规律和复杂性。
六、细胞信号转导异常与疾病的关系。
第四篇分子医学专题篇
第二十章常用分子生物学技术的原理及其应用(2学时)
一、分子杂交与印迹技术:
1.分子杂交与印迹技术的原理;2.探针:
概念、制备、应用原理;3.印迹技术的类别及其应用。
二、PCR技术:
1.PCR技术的概念及工作原理;2.PCR技术的主要用途;3.几种重要的PCR衍生技术。
三、基因文库:
1.基因文库的概念;2.基因组DNA文库、cDNA文库制备原理。
四、生物芯片技术:
1.基因芯片的概念及其应用;2.蛋白质芯片的概念及其应用。
五、生物大分子相互作用研究技术:
1.蛋白质相互作用研究技术;2.DNA-蛋白质相互作用分析技术。
第二十一章DNA重组及重组DNA技术(3学时)
一、自然界的DNA重组与基因转移:
1.同源重组的概念及机制;2.位点特异性重组的概念及其机制;3.转座重组的概念及其机制;4.原核细胞基因重组:
接合作用、转化作用、转导作用的概念及其机制。
二、重组DNA技术:
1.重组DNA技术的概念;2.重组DNA技术中的工具酶:
工具酶的概念、主要类型及其功能;2.重组DNA技术中常用的载体:
载体的主要类型、特点;3.重组DNA技术的基本原理及操作步骤。
三、重组DNA技术在医学中的应用。
第二十二章基因结构与功能分析技术【自学】
一、基因结构分析技术:
1.基因一级结构解析技术;2.基因转录起始点分析技术;3.基因启动子结构分析技术;4.基因编码序列分析技术。
二、基因表达产物分析技术:
1.转录水平分析技术;2.翻译水平分析技术。
三、基因的生物学功能鉴定技术:
1.依据功能鉴定技术;2.依据功能失活鉴定技术;3.随机突变鉴定技术。
第二十三章癌基因、肿瘤抑制基因与生长因子(3学时)
一、癌基因:
1.癌基因、细胞癌基因(原癌基因)、病毒癌基因的概念、分类;2.癌基因活化机制;3.原癌基因的产物与功能;4.癌基因表达产物与肿瘤发生的关系。
二、抑癌基因:
1.抑癌基因的概念、功能;2.一些抑癌基因与肿瘤发生的关系:
RB基因、TP53基因、PTEN基因等;3.抑癌基因与疾病的关系。
三、癌基因与抑癌基因在肿瘤发生过程中的作用特点。
四、生长因子:
生长因子的概念、分类、功能及作用机制;生长因子与疾病的关系。
第二十四章疾病相关基因的鉴定与基因功能研究【自学】
一、鉴定疾病相关基因的原则。
二、疾病相关基因克隆的策略和方法。
三、疾病相关基因的功能研究。
第二十五章基因诊断与基因治疗(1学时)
一、基因诊断:
1.基因诊断的概念;2.基因诊断的对象、样品来源、诊断技术;基因诊断在医学的应用。
二、基因治疗:
1.基因治疗的概念;2.基因治疗的基本策略、基本程序;3.基因治疗的临床应用现状。
第二十六章组学与医学【自学】
组学及各种组学的概念、研究技术及其应用。
主要参考书目
(略)
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