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16.疏水键:
非极性分子之间的一种弱的、非共价的相互作用。
如蛋白质分子中的疏水侧链避开水相而相互聚集而形成的作用力。
17.德华力:
中性原子之间通过瞬间静电相互作用产生的一种弱的分子间的力。
当两个原子之间的距离为它们的德华半径之和时,德华力最强。
18.盐析:
在蛋白质溶液中参加一定量的高浓度中性盐〔如硫酸氨〕,使蛋白质溶解度降低并沉淀析出的现象称为盐析。
19.盐溶:
在蛋白质溶液中参加少量中性盐使蛋白质溶解度增加的现象。
20.蛋白质的变性作用:
蛋白质分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。
蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以与一些变性剂的作用时,次级键遭到破坏导致天然构象的破坏,但其一级结构不发生改变。
21.蛋白质的复性:
指在一定条件下,变性的蛋白质分子恢复其原有的天然构象并恢复生物活性的现象。
22.蛋白质的沉淀作用:
在外界因素影响下,蛋白质分子失去水化膜或被中和其所带电荷,导致溶解度降低从而使蛋白质变得不稳定而沉淀的现象称为蛋白质的沉淀作用。
23.凝胶电泳:
以凝胶为介质,在电场作用下别离蛋白质或核酸等分子的别离纯化技术。
24.层析:
按照在移动相〔可以是气体或液体〕和固定相〔可以是液体或固体〕之间的分配比例将混合成分分开的技术。
25.透析〔dialysis〕是通过小分子经过半透膜扩散到水〔或缓冲液〕的原理,将小分子与生物大分子分开的一种别离纯化技术。
如:
血液透析〔Hemodialysis〕,简称血透,通俗的说法也称之为人工肾、洗肾,是血液净化技术的一种。
其利用半透膜原理,通过扩散、对流体各种有害以与多余的代废物和过多的电解质移出体外,到达净化血液的目的,并到达纠正水电解质与酸碱平衡的目的。
第二章核酸
1.单核苷酸(mononucleotide):
核苷与磷酸缩合生成的磷酸酯称为单核苷酸。
2.磷酸二酯键〔phosphodiesterbonds〕:
单核苷酸中,核苷的戊糖与磷酸的羟基之间形成的磷酸酯键。
3.不对称比率〔dissymmetryratio〕:
不同生物的碱基组成由很大的差异,这可用不对称比率〔A+T〕/〔G+C〕示。
4.碱基互补规律(complementarybasepairing):
在形成双螺旋结构的过程中,由于各种碱基的大小与结构的不同,使得碱基之间的互补配对只能在G…C〔或C…G〕和A…T〔或T…A〕之间进展,这种碱基配对的规律就称为碱基配对规律〔互补规律〕。
5.反密码子〔anticodon〕:
在tRNA链上有三个特定的碱基,组成一个密码子,由这些反密码子按碱基配对原那么识别mRNA链上的密码子。
反密码子与密码子的方向相反。
6.顺反子〔cistron〕:
基因功能的单位;
一段染色体,它是一种多肽链的密码;
一种结构基因。
7.核酸的变性、复性〔denaturation、renaturation〕:
当呈双螺旋结构的DNA溶液缓慢加热时,其中的氢键便断开,双链DNA便脱解为单链,这叫做核酸的“溶解〞或变性。
在适宜的温度下,分散开的两条DNA链可以完全重新结合成和原来一样的双股螺旋。
这个DNA螺旋的重组过程称为“复性〞。
8.退火〔annealing〕:
当将双股链呈分散状态的DNA溶液缓慢冷却时,它们可以发生
不同程度的重新结合而形成双链螺旋结构,这现象称为“退火〞。
9.增色效应〔hyperchromiceffect〕:
当DNA从双螺旋结构变为单链的无规那么卷曲状态时,它在260nm处的吸收便增加,这叫“增色效应〞。
10.减色效应〔hypochromiceffect〕:
DNA在260nm处的光密度比在DNA分子中的各个碱基在260nm处吸收的光密度的总和小得多〔约少35%~40%〕,这现象称为“减色效应〞。
11.噬菌体〔phage〕:
一种病毒,它可破坏细菌,并在其中繁殖。
也叫细菌的病毒。
12.发夹结构〔hairpinstructure〕:
RNA是单链线形分子,只有局部区域为双链结构。
这些结构是由于RNA单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,形成氢键结合而成的,称为发夹结构。
13.DNA的熔解温度〔Tm值〕:
引起DNA发生“熔解〞的温度变化围只不过几度,这个温度变化围的中点称为熔解温度〔Tm〕。
14.分子杂交〔molecularhybridization〕:
不同的DNA片段之间,DNA片段与RNA片段之间,如果彼此间的核苷酸排列顺序互补也可以复性,形成新的双螺旋结构。
这种按照互补碱基配对而使不完全互补的两条多核苷酸相互结合的过程称为分子杂交。
15.环化核苷酸(cyclicnucleotide):
单核苷酸中的磷酸基分别与戊糖的3’-OH与5’-OH形成酯键,这种磷酸酯的结构称为环化核苷酸。
第三章酶与辅酶
1.米氏常数〔Km值〕:
用Km值表示,是酶的一个重要参数。
Km值是酶反响速度〔V〕到达最大反响速度〔Vmax〕一半时底物的浓度〔单位M或mM〕。
米氏常数是酶的特征常数,只与酶的性质有关,不受底物浓度和酶浓度的影响。
2.底物专一性:
酶的专一性是指酶对底物与其催化反响的严格选择性。
通常酶只能催化一种化学反响或一类相似的反响,不同的酶具有不同程度的专一性,酶的专一性可分为三种类型:
绝对专一性、相对专一性、立体专一性。
3.辅基:
酶的辅因子或结合蛋白质的非蛋白局部,与酶或蛋白质结合得非常严密,用透析法不能除去。
4.单体酶:
只有一条多肽链的酶称为单体酶,它们不能解离为更小的单位。
分子量为13,000——35,000。
5.寡聚酶:
有几个或多个亚基组成的酶称为寡聚酶。
寡聚酶中的亚基可以是一样的,也可以是不同的。
亚基间以非共价键结合,容易为酸碱,高浓度的盐或其它的变性剂别离。
寡聚酶的分子量从35000到几百万。
6.多酶体系:
由几个酶彼此嵌合形成的复合体称为多酶体系。
多酶复合体有利于细胞中一系列反响的连续进展,以提高酶的催化效率,同时便于机体对酶的调控。
多酶复合体的分子量都在几百万以上。
7.激活剂:
但凡能提高酶活性的物质,都称激活剂,其局部是离子或简单的有机化合物。
8.抑制剂:
能使酶的必需基团或酶活性部位中的基团的化学性质改变而降低酶的催化活性甚至使酶的催化活性完全丧失的物质。
9.变构酶:
或称别构酶,是代过程中的关键酶,它的催化活性受其三维结构中的构象变化的调节。
10.同工酶:
是指有机体能够催化同一种化学反响,但其酶蛋白本身的分子结构组成却有所不同的一组酶。
11.诱导酶〔inducedenzyme):
是指当细胞中参加特定诱导物后诱导产生的酶,它的含量在诱导物存在下显著增高,这种诱导物往往是该酶底物的类似物或底物本身。
12.酶原:
酶的无活性前体,通常在有限度的蛋白质水解作用后,转变为具有活性的酶。
13.酶的比活力:
比活力是指每毫克蛋白质所具有的活力单位数,可以用下式表示:
活力单位数比活力=蛋白质量〔mg〕
14.活性中心:
酶分子中直接与底物结合,并催化底物发生化学反响的部位,称为酶的活性中心。
15、竞争性抑制作用〔competitiveinhibition〕:
通过增加底物浓度可以逆转的一种酶抑制类型。
一个竞争性抑制剂通常与正常的底物或配体竞争同一个蛋白质的结合部位。
这种抑制使得Km增大,而Vmax不变。
如磺胺药是二氢叶酸合成酶的竞争性抑制剂,进而减少菌体四氢叶酸的合成,
15.非竞争性抑制作用〔noncompetitiveinhibition〕:
抑制剂不仅与游离酶结合,也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反响抑制作用。
这种抑制使得Vmax变小,但Km不变。
16.反竞争性抑制作用〔uncompetitiveinhibition〕:
抑制剂只与酶-底物复合物结合,而不与游离酶结合的一种酶促反响抑制作用。
这种抑制作用使得Vmax,Km都变小,但Vmax/Km比值不变。
第四章生物氧化与氧化磷酸化
1.生物氧化:
生物体有机物质氧化而产生大量能量的过程称为生物氧化。
生物氧化在细胞进展,氧化过程消耗氧放出二氧化碳和水,所以有时也称之为“细胞呼吸〞或“细胞氧化〞(Cellularoxidation)。
生物氧化包括:
有机碳氧化变成CO2;
底物氧化脱氢、氢与电子通过呼吸链传递、分子氧与传递的氢结成水;
在有机物被氧化成CO2和H2O的同时,释放的能量使ADP转变成ATP。
2.呼吸链(respiratorychain):
有机物在生物体氧化过程中所脱下的氢原子,经过一系列有严格排列顺序的传递体组成的传递体系进展传递,最终与氧结合生成水,这样的电子或氢原子的传递体系称为呼吸链或电子传递链。
电子在逐步的传递过程中释放出能量被用于合成ATP,以作为生物体的能量来源。
3.氧化磷酸化:
在底物脱氢被氧化时,电子或氢原子在呼吸链上的传递过程中伴随ADP磷酸化生成ATP的作用,称为氧化磷酸化。
氧化磷酸化是生物体的糖、脂肪、蛋白质氧化分解合成ATP的主要方式。
4、磷氧比:
电子经过呼吸链的传递作用最终与氧结合生成水,在此过程中所释放的能量用于ADP磷酸化生成ATP。
经此过程消耗一个原子的氧所要消耗的无机磷酸的分子数〔也是生成ATP的分子数〕称为磷氧比值〔P/O〕。
如NADH的磷氧比值是3,FADH2的磷氧比值是2。
5.底物水平磷酸化:
在底物被氧化的过程中,底物分子部能量重新分布产生高能磷酸键〔或高能硫酯键〕,由此高能键提供能量使ADP〔或GDP〕磷酸化生成ATP〔或GTP〕的过程称为底物水平磷酸化。
此过程与呼吸链的作用无关,以底物水平磷酸
化方式只产生少量ATP。
如在糖酵解〔EMP〕的过程中,3-磷酸甘油醛脱氢后产生的1,3-二磷酸甘油酸,在磷酸甘油激酶催化下形成ATP的反响,以与在2-磷酸甘油酸脱水后产生的磷酸烯醇式丙酮酸,在丙酮酸激酶催化形成ATP的反响均属底物水平的磷酸化反响。
另外,
在三羧酸环〔TCA〕中,也有一步反响属底物水平磷酸化反响,如α-酮戊二酸经氧化脱羧后生成高能化合物琥珀酰~CoA,其高能硫酯键在琥珀酰CoA合成酶的催化下转移给GDP生成GTP。
然后在核苷二磷酸激酶作用下,GTP又将末端的高能磷酸根转给ADP生成ATP。
6.能荷:
能荷是细胞中高能磷酸状态的一种数量上的衡量,能荷大小可以说明生物体
中ATP-ADP-AMP系统的能量状态。
能荷=[ATP]+12[ADP][ATP]+[ADP]+[AMP]
第五章糖代
1.糖异生Gluconeogenesis:
非糖物质〔如丙酮酸乳酸甘油生糖氨基酸等〕转变为葡萄糖的过程。
2.Q酶:
Q酶是参与支链淀粉合成的酶。
功能是在直链淀粉分子上催化合成〔α-1,6〕糖苷键,形成支链淀粉。
3.乳酸循环乳:
酸循环是指肌肉缺氧时产生大量乳酸,大局部经血液运到肝脏,通过糖异生作用肝糖原或葡萄糖补充血糖,血糖可再被肌肉利用,这样形成的循环称乳酸循环。
4.发酵:
厌氧有机体把糖酵解生成NADH中的氢交给丙酮酸脱羧后的产物乙醛,使之生成乙醇的过程称之为酒精发酵。
如果将氢交给病酮酸丙生成乳酸那么叫乳酸发酵。
5.变构调节:
变构调节是指某些调节物能与酶的调节部位结合使酶分子的构象发生改变,从而改变酶的活性,称酶的变构调节。
6.糖酵解途径(Glycolyticparthway):
糖酵解途径指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的阶段,是体糖代最主要途径。
7.糖的有氧氧化:
糖的有氧氧化指葡萄糖或糖原在有氧条件下氧化成水和二氧化碳的过程。
是糖氧化的主要方式。
8.肝糖原分解:
肝糖原分解指肝糖原分解为葡萄糖的过程。
9.磷酸戊糖途径:
磷酸戊糖途径指机体某些组织〔如肝、脂肪组织等〕以6-磷酸葡萄糖为起始物在6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化下形成6-磷酸葡萄糖酸进而代生成磷酸戊糖为中间代物的过程,又称为磷酸已糖旁路。
10.D-酶:
一种糖苷转移酶,作用于α-1,4糖苷键,将一个麦芽多糖的片段转移到葡萄糖、麦芽糖或其它多糖上。
11.糖核苷酸:
单糖与核苷酸通过磷酸酯键结合的化合物,是双糖和多糖合成中单糖的活化形式与供体。
第六章脂类代
1.必需脂肪酸:
为人体生长所必需但有不能自身合成,必须从事物中摄取的脂肪酸。
在脂肪中有三种脂肪酸是人体所必需的,即亚油酸,亚麻酸,花生四烯酸。
2.α-氧化:
α-氧化作用是以具有3-18碳原子的游离脂肪酸作为底物,有分子氧间接参与,经脂肪酸过氧化物酶催化作用,由α碳原子开场氧化,氧化产物是D-α-羟脂肪酸或少一个碳原子的脂肪酸。
3.脂肪酸的β-氧化:
脂肪酸的β-氧化作用是脂肪酸在一系列酶的作用下,在α碳原子和β碳原子之连续裂,β碳原子氧化成羧基生成含2个碳原子的乙酰CoA和比原来少2个碳原子的脂肪酸。
4.脂肪酸ω-氧化:
ω-氧化是C5、C6、C10、C12脂肪酸在远离羧基的烷基末端碳原子被氧化成羟基,再进一步氧化而成为羧基,生成α,ω-二羧酸的过程。
5.乙醛酸循环:
一种被修改的柠檬酸循环,在其异柠檬酸和苹果酸之间反响顺序有改变,以与乙酸是用作能量和中间物的一个来源。
某些植物和微生物体有此循环,他需要二分子乙酰辅酶A的参与;
并导致一分子琥珀酸的合成。
6.柠檬酸穿梭:
就是线粒体的乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸,然后经膜上的三羧酸载体运至胞液中,在柠檬酸裂解酶催化下,需消耗ATP将柠檬酸裂解回草酰乙酸和,后者就可用于脂肪酸合成,而草酰乙酸经复原后再氧化脱羧成丙酮酸,丙酮酸经膜载体运回线粒体,在丙酮酸羧化酶作用下重新生成草酰乙酸,这样就可又一次参与转运乙酰CoA的循环。
7.乙酰CoA羧化酶系:
大肠杆菌乙酰CoA羧化酶含生物素羧化酶、生物素羧基载体蛋白〔BCCP〕和转羧基酶三种组份,它们共同作用催化乙酰CoA的羧化反响,生成丙二酸单酰-CoA。
8.脂肪酸合酶系统:
脂肪酸合酶系统包括酰基载体蛋白〔ACP〕和6种酶,它们分别是:
乙酰转酰酶;
丙二酸单酰转酰酶;
β-酮脂酰ACP合成酶;
β-酮脂酰ACP复原酶;
β-羟;
脂酰ACP脱水酶;
烯脂酰ACP复原酶。
9.酮体(Ketonebodies):
由于肝脏中脂肪酸氧化很不完全而致体出现脂肪酸的中间氧化代产物,这些产物是乙酰乙酸、β-羟基丁酸与丙酮,此三者统称为酮体。
第八章含氮化合物代
1.蛋白酶:
以称肽链切酶〔Endopeptidase〕,作用于多肽链部的肽键,生成较原来含氨基酸数少的肽段,不同来源的蛋白酶水解专一性不同。
2.肽酶:
只作用于多肽链的末端,根据专一性不同,可在多肽的N-端或C-端水解下氨基酸,如氨肽酶、羧肽酶、二肽酶等。
3.氮平衡〔nitrogenbalance〕:
正常人摄入的氮与排出氮到达平衡时的状态,反响正常人的蛋白质代情况。
4.生物固氮:
利用微生物中固氮酶的作用,在常温常压条件下将大气中的氮复原为氨的过程〔N2+3H2→2NH3〕。
5.硝酸复原作用:
在硝酸复原酶和亚硝酸复原酶的催化下,将硝态氮转变成氨态氮的过程,植物体硝酸复原作用主要在叶和根进展。
6.氨的同化:
由生物固氮和硝酸复原作用产生的氨,进入生物体后被转变为含氮有机化合物的过程。
7.转氨作用:
在转氨酶的作用下,把一种氨基酸上的氨基转移到α-酮酸上,形成另一种氨基酸。
8.尿素循环:
尿素循环也称鸟氨酸循环,是将含氮化合物分解产生的氨转变成尿素的过程,有解除氨毒害的作用。
9.生糖氨基酸:
在分解过程中能转变成丙酮酸、α-酮戊二酸乙、琥珀酰辅酶A、延胡索酸和草酰乙酸的氨基酸称为生糖氨基酸。
10.生酮氨基酸:
在分解过程中能转变成乙酰辅酶A和乙酰乙酰辅酶A的氨基酸称为生酮氨基酸。
11.核酸酶:
作用于核酸分子中的磷酸二酯键的酶,分解产物为寡核苷酸或核苷酸,根据作用位置不同可分为核酸外切酶和核酸切酶。
12.限制性核酸切酶:
能作用于核酸分子部,并对某些碱基顺序有专一性的核酸切酶,是基因工程中的重要工具酶。
13.氨基蝶呤:
对嘌呤核苷酸的生物合成起竞争性抑制作用的化合物,与四氢叶酸结构相似,又称氨基叶酸。
14.一碳单位:
仅含一个碳原子的基团如甲基〔CH3-、亚甲基〔CH2=〕、次甲基〔CH≡〕、甲酰基〔O=CH-)、亚氨甲基〔HN=CH-〕等,一碳单位可来源于甘氨酸、氨酸、丝氨酸、组氨酸等氨基酸,一碳单位的载体主要是四氢叶酸,功能是参与生物分子的修饰。
第九章核酸的生物合成
1.半保存复制(semi-conservativereplication〕:
双链DNA的复制方式,其中亲代链别离,每一子代DNA分子由一条亲代链和一条新合成的链组成。
2.不对称转录:
转录通常只在DNA的任一条链上进展,这称为不对称转录。
3.逆转录〔reservetranscript):
Temin和Baltimore各自发现在RNA肿瘤病毒中含有RNA指导的DNA聚合酶,才证明发生逆向转录,即以RNA为模板合成DNA。
4.冈崎片段:
一组短的DNA片段,是在DNA复制的起始阶段产生的,随后又被连接酶连接形成较长的片段。
在大肠杆菌生长期间,将细胞短时间地暴露在氚标记的胸腺嘧啶中,就可证明冈崎片段的存在。
冈崎片段的发现为DNA复制的科恩伯格机理提供了依据。
5.复制叉:
复制DNA分子的Y形区域。
在此区域发生链的别离与新链的合成。
6.领头链:
DNA的双股链是反向平行的,一条链是5/→3/方向,另一条是3/→5/方向,上述的起点处合成的领头链,沿着亲代DNA单链的3/→5/方向〔亦即新合成的DNA沿5/→3/方向〕不断延长。
所以领头链是连续的。
7.随后链:
的DNA聚合酶不能催化DNA链朝3/→5/方向延长,在两条亲代链起点的3/端一侧的DNA链复制是不连续的,而分为多个片段,每段是朝5/→3/方向进展,所以随后链是不连续的。
8.有意义链:
即华森链,华森——克里格型DNA中,在体被转录的那股DNA链。
简写为Wstrand。
9.光复活:
将受紫外线照射而引起损伤的细菌用可见光照射,大局部损伤细胞可以恢复,这种可见光引起的修复过程就是光复活作用。
10.重组修复:
这个过程是先进展复制,再进展修复,复制时,子代DNA链损伤的对应部位出现缺口,这可通过分子重组从完整的母链上,将一段相应的多核苷酸片段移至子链的缺口处,然后再合成一段多核昔酸键来填补母链的缺口,这个过程称为重组修复。
11.含子:
真核生物的mRNA前体中,除了贮存遗传序列外,还存在非编码序列,称为含子。
12.外显子:
真核生物的mRNA前体中,编码序列称为外显子。
13.基因载体:
外源DNA片段〔目的基因〕要进入受体细胞,必须有一个适当的运载工具将带入细胞,并载着外源DNA一起进展复制与表达,这种运载工具称为载体。
14.质粒:
是一种在细菌染色体以外的遗传单元,一般由环形双链DNA构成,其大小从1—200Kb。
15.中心法那么(geneticcentraldogma),是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。
也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。
这是所有有细胞结构的生物所遵循的法那么。
在某些病毒中的RNA自我复制〔如烟草花叶病毒等〕和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程〔某些致癌病毒〕是对中心法那么的补充。
第十一章代调节
1.诱导酶:
由于诱导物的存在,使原来关闭的基因开放,从而引起某些酶的合成数量明显增加,这样的酶称为诱导酶
2.标兵酶:
在多酶促系列反响中,受控制的部位通常是系列反响开头的酶,这个酶一般是变构酶,也称标兵酶。
3.操纵子:
在转录水平上控制基因表达的协调单位,包括启动子〔P〕、操纵基因〔O〕和在功能上相关的几个结构基因。
4.衰减子:
位于结构基因上游前导区调节基因表达的功能单位,前导区转录的前导RNA通过构象变化终止或减弱转录。
5.阻遏物:
由调节基因产生的一种变构蛋白,当它与操纵基因结合时,能够抑制转录的进展。
6.辅阻遏物:
能够与失活的阻碣蛋白结合,并恢复阻遏蛋白与操纵基因结合能力的物质。
辅阻遏物一般是酶反响的产物。
7.降解物基因活化蛋白:
由调节基因产生的一种cAMP受体蛋白,当它与cAMP结合时被激活,并结合到启动子上促进转录进展。
是一种正调节作用。
8.腺苷酸环化酶:
催化ATP焦磷酸裂解产生环腺苷酸〔cAMP〕的酶。
9.共价修饰:
某种小分子基团可以共价结合到被修饰酶的特定氨基酸残基上,引起酶
分子构象变化,从而调节代的方向和速度。
10.级联系统:
在连锁代反响中一个酶被激活后,连续地发生其它酶被激活,导致原始调节信号的逐级放大,这样的连锁代反响系统称为级联系统。
11.反响抑制:
在代反响中,反响产物对反响过程中起作用的酶产生的抑制作用。
12.穿插调节:
代产物不仅对本身的反响过程有反响抑制作用,而且可以控制另一代物在不同途径中的合成。
13.前馈激活:
在反响序列中,前身物质对后面的酶起激活作用,使反响向前进展。
14.钙调蛋白:
一种依赖于钙的蛋白激酶,酶蛋白与钙结合引起酶分子构象变化,调解酶的活性。
如磷酸化酶激酶是一种依赖于钙的蛋白激酶。
第十二章蛋白质的生物合成
1.密码子〔codon〕:
存在于信使RNA中的三个相邻的核苷酸顺序,是蛋白质合成中某一特定氨基酸的密码单位。
密码子确定哪一种氨基酸叁入蛋白质多肽链的特定位置上;
共有64个密码子,其中61个是氨基酸的密码,3个是作为终止密码子。
2.同义密码子〔synonymcodon〕:
为同一种氨基酸编码的几个密码子之一,例如密码子UUU和UUC二者都为苯丙氨酸编码。
3.反密码子〔anticodon〕:
在转移RNA反密码子环中的三个核苷酸的序列,在蛋白质合成过互补的碱基配对,这局部结合到信使RNA的特殊密码上。
4.变偶假说〔Wobblehypothesis〕:
克里克为解释tRNA分子如何去识别
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