以临床数据仓库为核心的医院大数据平台构建.pdf
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中国医院管理第35卷第11期(总第412期)2015年11月ChineseHospitalManagementVol.35No.11(SUMNo.412)Nov.2015专题研究Zhuantiyanjiu医院信息化建设在保障与支持医药卫生体制改革顺利进行和保证医院可持续发展等方面的作用日益显著。
由于大型公立医院信息化建设时期较长,各业务信息子系统分散,各数据库模块信息耦合困难,势必会造成实时抓取数据真实性差、稳定性差、关联性差。
因此,通过大数据集成平台的建设,能够有效采集数据、高度集成数据、实时分析数据,提高数据信息的准确性和可利用性,实现医院内部各信息系统之间的数据整合、信息共享和流程协同,提高医院精细化管理水平。
1背景上海某三甲医院经过近20年的信息化建设,已经完成了医院信息系统(HIS)、实验室信息系统(LIS)、放射科信息管理系统(RIS)、影像归档和通信系统(PACS)、手术麻醉管理系统、物资管理系统等多个信息系统的构建。
近年来,该院根据中央及地方政府对公立医院信息化建设的要求,遵照行业规范与标准,结合医院自身发展的业务需要和战略发展目标,开发建设全院整体化信息集成平台。
在完善顶层架构的基础上,进一步优化、改造与增强现有的临床业务系统,深度挖掘与系统整合所有业务数据库表单,建立自动化、智能化的闭环医嘱流程,健全数据采集的节点和内容,提高数据质量及采集实时性,以满足临床、管理、科研流程业务和对数据的分析利用需求,增强医院整体竞争优势,促进医、教、研各方面的快速发展。
2以临床数据仓库为核心的医院信息集成平台的建设2.1关键术语
(1)面向服务的体系架构(ServiceOrientedArchitecture,SOA):
是一个组件模型,其架构思想主张系统设计与实现相分离,使系统整体设计思想不再受制于技术实现因素。
面向服务体系架构设计摆脱了技术的束缚,为解决异构系统通信与互操作问题提供了一种行之有效的解决方案1。
(2)临床数据仓库(ClinicalDataRepository,CDR):
是一个面向主题的(subjectoriented)、集成的(integrated)、相对稳定的(non-volatile)、反映历史变化的(timevariant)数据集合,用于支持管理决策(DecisionMakingSupport)的临床数据中心源。
具有数据高效率、高质量、可扩展性和面向主题的特征2。
(3)医院信息集成平台:
是将临床各类信息子系统的非结构化数据,如HIS、CIS(医院临床信息系统)、LIS、EMR(电子病历系统)的数据库高度集成,以协助医务人员在系统集成平台上能够随时访问所需的临床数据,从而及时、有效地作出临床医学决策3。
2.2主要建设内容2.2.1关键平台服务(开发新建)
(1)以CDR为核心的全院数据中心平台:
汇集整合全院现有系统的所有数据,参照CDR数据模型进行梳理、存储和重构,供跨系统、跨部门的数据分析利用。
(2)企业服务总线(ESB)服务:
建设ESB公以临床数据仓库为核心的医院大数据平台构建*吴正一崔迎慧陆耀金文忠摘要上海某三甲医院基于面向服务的体系架构,采用HL7、CDA、IHE等国际标准和规范,以临床数据仓库为核心构建全院级别的大数据信息集成平台,实现了医院内部各信息系统的数据整合、信息共享和流程协同,满足临床、管理、科研流程业务和对数据分析利用的需求,提高医院精细化管理水平,增强整体竞争优势,促进医、教、研各方面的快速可持续发展。
关键词临床数据仓库大数据集成平台医院信息系统中图分类号R197.323.1文献标志码B文章编号1001-5329(2015)11-0013-03ConstructionoftheHospitalInformationIntegratedPlatformwithClinicalDataRepositoryastheCoreComponent/WUZheng-yi,CUIYing-hui,LUYao,etal./ChineseHospitalManagement,2015,35(11):
13-15AbstractBasedonServiceOrientedArchitecture,andthroughusingHL7,CDAandIHE,onetertiaryhospitalinShanghaihasbuiltalarge-scaledataintegratedplatformwithclinicaldatarepository(CDR)asthecorecomponent,thusachieveddataintegration,informationsharingandprocesscoordinationoftheinformationsystemsofthehospital.Itcansatisfytheneedsofclinicalservice,hospitalmanagementandscientificresearch,meanwhileimprovetheprecisemanagementlevel,raisecompetitiveadvantageandpromotesustainabledevelopmentofthehospital.Keywordsclinicaldatarepository,bigdataintegratedplatform,HospitalInformationSystemFirst-authorsaddressShanghaiNinthPeoplesHospitalAffiliatedtoShanghaiJiaotongUniversitySchoolofMedicine,Shanghai,200011,China*基金项目:
上海市卫生和计划生育委员会科研课题(20124439)上海交通大学医学院附属第九人民医院上海200011通讯作者:
崔迎慧;E-mail:
13中国医院管理第35卷第11期(总第412期)2015年11月ChineseHospitalManagementVol.35No.11(SUMNo.412)Nov.2015共服务,支持数据交换和流程整合。
(3)患者主索引服务(EMPI):
建立患者唯一身份标识,跟其各类就诊卡、就诊号进行关联,做到一次登录,终身可用。
(4)统一用户管理服务:
提供全院各类用户认证管理和授权管理,用户只要记住一套用户名/密码,就可以登录所有授权访问的系统。
(5)统一通讯服务:
建立企业通讯录,支持联系人查询、发送即时消息、语音视频等功能,实现在线会诊、多学科综合治疗等协同医疗业务。
2.2.2核心业务系统(开发新建与优化改造)
(1)新建的系统:
门诊预约系统、检查预约系统、临床信息共享视图、随访管理系统、临床路径系统、护理管理系统、医疗质量监控系统、抗菌药物管理系统、院感监测系统、医保费用分析系统、以单病种数据库为重点的临床科研应用、样本库、协同医疗系统、员工360度视图、检查检验报告单网上查询服务。
(2)加强或改造的系统:
电子病历系统(包括病历书写器、电子医嘱)、绩效考核管理系统。
2.3系统架构大数据集成平台是将医院各业务系统间的紧耦合变为松耦合,在较高层次上将医院信息系统中的数据综合、归类,而各个业务系统之间可以分离,保障各个医院信息系统的有效运转。
上海某三甲医院采用分层架构来对医院的信息系统进行整合,通过架构分层,在原有基础业务信息系统之上架设一层集成平台,形成“第二层数据”,在此之上构建集成业务类应用。
这样以集成平台为基础建立起来的IT架构具有开放的接口服务体系,这些接口服务体系将原有紧耦合的信息系统分层解耦合为相对独立的信息子系统。
2.4数据整合平台2.4.1全院数据中心全院数据中心平台立足于医院已有的信息系统,采用数据汇集(DataAggregation)技术,将封闭在多套孤立信息系统中的数据释放出来,实现了物理集中;然后通过对数据的离散化处理,使之成为可重复使用的数据元,可根据不断变化的查询、应用需求组合成各种各样的视图,以提供前所未有的灵活性,将数据转变成为各种有价值的信息,以帮助医院实现持续的质量改进和服务创新。
同时,通过全院数据中心平台实现全院数据共享,可大幅提高医院整体信息化水平,实现医院信息化建设的跨越式发展。
全院数据中心平台在技术上具体以下特点和优势:
(1)实现了医院IT架构的松耦合,所有业务应用系统将采集的数据物理集中到数据中心平台上,降低了单一系统的升级、故障和替换对其他系统和医院整体业务的影响,从根本上优化了医院的IT技术架构。
(2)全院所有临床、管理、质控和科研数据物理集中在数据中心平台,经过对原始数据的离散化解析处理,所产生的元数据支持灵活的查询利用需求。
(3)提供授权用户快速的数据查询、过滤和展现工具,终端用户可利用现有数据随时创建个性化的浏览视图,以快速响应不断变化的临床和管理要求。
(4)通过全院数据中心平台建设,逐步形成医院的数据标准与规范,包括数据共享接口规范、临床数据集规范、科研数据集规范、管理运营数据集规范、数据获取规范、数据对外发布规范等,使得未来引进和建设新的IT系统变得有章可依。
(5)全院数据中心平台具有高度的可扩展性,支撑医院业务向区域延伸,实现与各级各类区域卫生信息服务平台的接口整合和数据共享。
所有输入数据储存在数据储存库的不同数据表格中,数据表格被设计为平面化和大部分非规范化的结构,该结构已获得优化,用以进行快速数据检索。
与建立复杂数据模式相反,允许在必要时建立与基准表格不同的多种数据模式。
这一结构层的两个重要组件分别是数据库(databases)和基础视图(baseviews)。
所有信息根据其属性储存在不同的数据库中。
例如,数据储存库可用一个数据库储存所有患者入院、转院和出院(Admission,TransferandDischarge,ADT)信息,而用另一个数据库储存所有实验室研究结果。
还可轻松创建其他自定义数据库,以满足在可扩展的数据储存库中捕获任何未来信息的需求。
然后,存储在数据库中的数据通过系统应用程序服务基础视图中的SQL服务器视图或SQL服务器表格显示出来。
基础视图是数据提取层,从不同数据表或数据库向系统客户提供相关信息。
可配置的基础视图能够集成相关患者信息,然后根据职权范围(如向临床医生发送临床视图,向医院管理团队发送业务视图)以最快的速度发送至用户。
此外,它还可以用作数据集成点为外部应用程序服务,以便从数据储存库中检索患者信息。
2.4.2CDRCDR是一个整合多个来源的临床数据,提供以患者为中心的统一视图的实时数据库4。
在临床数据仓库的构建中,诊疗数据均围绕“以患者为中心”进行组织,临床用户可以从多个角度查询、浏览和分析数据,其中的诊疗数据包括患者基本信息、历次就诊病史、门急诊和住院诊断、处方信息、检验结果、放射、超声、病理、内镜检查报告、医学影像、费用信息等。
为提高CDR的数据质量,通过受控医学词汇表(CMV)保证所有人对临床数据语义理解的一致。
该院构建的CDR具有以下特征:
数据集中式存储和管理,重点关注各类临床数据,各类数据具备实时性,各类数据具备长期性,围绕个体患者组织所有数据。
CDR建设参照、遵循的标准规范包括:
电子病历基本架构与数据标准(试行)电子病历系统功能规范(试行)基于电子病历的医院信息平台建设技术解决方案(1.0版)、国际通用的HL73.0RIM模型、欧盟openEHR规范。
在全院数据中心平台上,参照原卫生部制定的医院数据集标准以及国际通用的行业技术标准(如HL73.0RIM模型),以CDR的方式实现对数据的采集、处理、存储、建模和利用;在此基础上可按需构建专题临床数据库(CDW),服务于医院的诊疗、质控、科研和管理工作。
CDR建设的最直接效果就是构建以患者个人为中心、整合门急诊和住院全部诊疗数据的360度全息视图,以快速提供临床医护人员所需要的全部病人信息。
2.4.3运营数据仓库运营数据仓库(OperationalDataRepository,ODR)是一个面向主题的、集成的、近实时的、不断刷新的运营管理数据集合,它反映了在某一个时间切面瞬间医院的管理运营状况。
ODR基于全院数据中心平台之上,其存储结构是以全院以临床数据仓库为核心的医院大数据平台构建吴正一等14中国医院管理第35卷第11期(总第412期)2015年11月ChineseHospitalManagementVol.35No.11(SUMNo.412)Nov.2015范围所有相关业务系统的数据全面、统一地构建关系型实体来体现的,ODR中的数据是基于分析主题进行组织而不是基于业务系统的功能进行组织。
ODR只存储了当前的数据,而且数据不断更新,因此其数据的刷新很快,过期的数据将会被“挥发”掉。
因此ODR的存储量取决于业务接口数据的抽取与刷新频率,同时取决于全院用户数。
从ODR的作用和实现来说,ODR将各个孤立的业务系统的运营数据集成起来,形成全院的统一数据视图,并可实现ODR的数据共享。
利用商业智能(BI)技术,在全院数据中心平台基础上,建立以分析为目标的运营管理数据仓库或数据集市。
由于全院数据中心平台已经完成数据的采集、离散化和梳理,只需按要求提供给ODR,由ODR分主题集成、加载到相应的数据仓库或数据集市中,构建各类管理运营、医疗质量等统计分析报表体系,支持数据的深挖钻取。
全院大数据中心平台作为医院信息化的核心,将现有系统的数据离散化之后,重新组织成可以再利用的数据结构,并且基于全院大数据中心平台才能实现集成应用。
ODR从全院大数据中心平台获得源数据,然后再根据绩效分析的指标以及运营报表的统计内容,生成各类报表。
2.4.4Web呈现Web呈现是一种轻型访问应用程序,认证的医院管理人员、临床医生等可通过内网或外网连接只读查看特定系统功能和资源。
用户可以通过IE网络浏览器实时查看数据(临床、财务和管理),查看共享患者的授权视图,通过单一形式验证(用户名/密码)后查看。
2.5流程整合平台为了进一步优化医院信息基础架构,建立松耦合SOA服务,使整个医疗应用系统可以根据环境的变化,快速实施业务的变更。
通过流程整合平台的建设,规范新建系统的接入标准,松耦合基础平台,降低“点对点”接口带来的运维复杂度和成本,提升应用集成和可交互性、安全性。
在SOA架构的基础上,利用SOA所提供的面向服务的特性,把原有医院信息系统中的应用和资源转变为可共享的标准服务,然后通过对服务的调用来完成医院信息系统之间数据交互与业务协同,实现了异构、分布式应用系统之间的敏捷、快速、松耦合、高可靠的应用集成5。
以企业服务总线的模式实现SOA的应用,规范医院应用系统的医疗服务标准。
本信息平台项目建设中微软ESB解决方案是以BiZTalk技术为内核,进行二次开发建设,构成医院信息基础架构,以ESB的模式实现SOA应用,定义可重用的、可组装的业务活,规范医院应用系统的医疗服务标准,完成全院IT架构的松耦合化。
通过服务的统一注册、发布和管理,提供包括统一用户管理、患者主索引、统一基础编码(药品、诊断、医院科室)、统一通讯等基础服务的注册和发布。
2.6展示应用平台上海某三甲医院建立的大数据集成平台,在应用终端建立了六大功能平台:
医院运营管理平台(包括实时业务量、业务经济指标、成本控制等)、医疗质量监测平台(对接国家卫生计生委HQMS统计评价指标、申康中心单病种绩效考核指标及质控环节管理等)、绩效考核分配平台、人员资格资质与授权管理平台、患者信息共享视图平台和科研MedRis平台(可与生物样本库、基因组、蛋白组等科研数据库及临床随访数据库对接)。
3讨论上海某三甲医院基于SOA的开放架构,采用HL7、CDA、IHE等国际标准和规范,以CDR为核心构建全院级别的大数据集成平台,有效整合了全院5年历史数据,4亿行数据1.5T,有着数据种类多、数据量大、涵盖范围广的鲜明特点;实时数据即时生成,每3秒钟新数据自动导入CDR,保证了数据及时、准确,大数据集成平台的应用与操作便捷,对所有病人身份统一识别,提供患者主索引服务(EMPI),患者历次就医记录可关联集成;同时设置分级权限管理,按用户权限进行分类查询,院领导、科室负责人拥有不同的系统操作权限。
该信息集成平台参照CDR数据模型进行梳理、存储和重构,实现了信息共享、流程协同。
通过将各系统点对点的接口模式改造为各系统面对集成平台的多对一的接口模式,大大降低了业务系统集成的复杂度。
建立标准的数据交换模式,一定程度上实现了医院内部各子系统的互联互通,消除信息孤岛,实现了医院信息数据的共享,为数据实时采集、分析提供了有力支撑。
随着医疗信息技术的迅猛发展及快速更新,信息量日益丰富,单纯依靠系统的各个医疗信息系的归口信息管理模式已远远不能满足现代化医院发展的步伐,医疗信息系统的交互与集成研究已经成为建设全面、专业、集成和智能的数字化医院的迫切需求。
构建以临床数据仓库为核心的全院数据中心平台,不仅可以实现医院内不同部门的、异构信息系统间的临床交换、共享、互操作和统一管理,而且能够将临床业务和临床用户的需求与临床数据的智能化应用相结合,为医院提供智能化临床数据浏览的临床医生门户、临床管理数据分析门户、临床科研门户以及患者健康门户,实现各类集成业务应用。
全面集成的智能化信息系统必将实现医院“人、财、物”“医、教、研”基于统一平台的协同管理,数据仓库和商业智能技术将使医院领导者的决策得到真正的支持,有效提高医院精细化管理水平,保障医院健康可持续发展。
当前,基于信息集成平台的建设来实现医院内部绩效的实时管理与评价、提高各管理层级的调控能力与决策水平具有重要发展前景,已成为研究的主攻方向。
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