NCBI序列比对方法与实例操作.ppt
- 文档编号:18835464
- 上传时间:2024-01-01
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NCBI序列比对方法与实例操作.ppt
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,点击进入,点击此处进入核酸序列比对,将FASTA格式的序列输入这里,此处可自动识别比对序列名称,点击此处进入序列比对,已知序列编号,所查询分子类型,比对序列长度,序列相似性比对图谱,数据库名称,不同颜色代表两种比对序列具有的相同的碱基数目不同。
例如,红色,代表与比对的核酸序列有200个以上的碱基是相同的。
序列长度,序列相似性比对结果,相似序列一:
番茄ch07染色体全基因组,相似序列二:
潘那丽番茄ch07染色体全基因组,数据库相似序列名称,类似性积分,E值为匹配期望值。
说明可以找到与搜索序列相匹配的其它序列的几率。
E值越接近零,越不可能找到其它的匹配序列,其背后的含义就是E值越少,匹配度越好,相似度,数据库标识,序列编号,匹配序列长度,匹配范围,对比空白,相似序列,即输入序列和搜索到序列的匹配率,输入序列被随机搜索出来的概率,该值越小越好,询问序列和数据库里面序列的互补链匹配,分数越高,则同源性越好,空白,ZB04091969(MALINGSHU)-A68-M13+_D09,预测:
马铃薯单酰基甘油脂酶ABHD-6相似mRNA,ZB04091969(MALINGSHU)-A69-M13+_E09,番茄ch03染色体全基因组,
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- 关 键 词:
- NCBI 序列 方法 实例 操作