大规模皮层网络拓扑影响精品资料.docx
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大规模皮层网络拓扑影响精品资料
大规模皮层网络拓扑影响
1材料与方法
1.1T1磁共振加权影像75例年龄范围在50~70岁之间右利手的健康老年人被作为受试对象,其中39例女性,36例男性。
75例对象的平均年龄为(60.5±5.2)岁。
受教育程度12~20年之间,平均受教育程度为(16.6±2.2)年。
MMSE评分的范围在25~30分之间,平均评分是(29.3±1.0)分,具体对象特征如表1所示。
所有的磁共振影像数据都在美国亚利桑那大学附属医院采集。
受试者纳入标准:
无精神异常史及其它影响中枢神经系统的疾病,简易精神状态量表检查评分均≥25分,汉密尔顿抑郁评定量表≤10分。
采用GESignaⅡ3.0T核磁共振扫描仪,基于三维扰相梯度回波序列(3D-SPGR)采集204张连续冠状面T1加权像(T1WI),扫描参数如下:
TR5.3ms,TE2.0ms,TI500ms,翻转角度15°,矩阵:
256×256,FOV=256mm×256mm,层厚1mm。
1.2DTI大脑结构连接组构建所有数据均通过基于Ubuntu平台的工作站,调用FreeSurfer软件包[14-16]进行自动化分析处理。
分析处理过程分为体积处理流程与表面处理流程两大部分。
体积处理流程包括图像灰度标准化、不均匀磁场的校正、到Talairach空间的配准[17]、非脑组织的去除和白质(WhiteMatter,WM)与灰质(GreyMatter,GM)的分割等。
表面处理流程包括对白质曲面进行三维重建,从白质曲面出发,沿着灰质梯度方向向外膨胀得到灰质外表面曲面。
定义灰质曲面和白质曲面间的距离为脑皮层厚度,采用T-average算法计算皮层厚度[18]。
灰质外表面向外膨胀,得膨胀曲面。
膨胀曲面经过球状形变后与模板进行高维配准,依据Desikan-Killiany图谱对皮层进行自动分区[19],同时计算每个区域皮层的厚度。
Desikan-Killiany图谱将全脑分为70个脑区(左右半脑各35个),其中胼胝体没有灰质厚度,因此最后得到68个脑区(左右半脑各34个)的皮层厚度。
每个脑区的皮层厚度为该脑区所有点的厚度的平均值。
Desikan-Killiany模板所划分的68个脑区被定义为脑网络中的节点,脑区间皮层厚度的皮尔逊相关系数代表网络的边。
将75例对象按照年龄分为四组,即50~55岁(11例)、55~60岁(26例)、60~65岁(18例)、65~70岁(20例)。
每组每个样本每个脑区的皮层厚度先通过回归去除脑区平均厚度、年龄和性别的影响,用残差作为原始的皮层厚度进行后续计算。
随后,计算任意两个脑区皮层厚度的皮尔逊相关系数得到相关系数矩阵。
其中,xi表示其中一个脑区皮层厚度的第i个样本值,表示该脑区皮层厚度的平均值;yi表示另一个脑区皮层厚度的的第i个样本值,表示此脑区皮层厚度的平均值;n为样本值数量,这里n为75。
相关性分析后,得到相关系数连接矩阵。
这里得到的相关系数有正有负,对所有的相关系数取绝对值得到矩阵Cij(i,j=1,2,3……68),接着选定阈值对Cij进行二值化,即若Cij大于阈值则置1,反之则置0,这样就得到二值化矩阵Aij(i,j=1,2,3……68)。
每一组的皮层厚度网络G有N个节点K条边,N=68,如果所有组取相同的阈值进行二值化,那么二值化后每个组皮层厚度网络G边的数量有可能不同,对应不同的网络拓扑结构,这样就不能很好的比较组间年龄的变化对网络拓扑结构的影响。
我们这里利用Desikan等[19]提出的网络稀疏度概念解决了这一问题。
稀疏度S被定义为网络中实际存在的边数与最大可能存在的边数的比值,即S=K/[N(N-l)/2]。
选定同一个稀疏度二值化所有相关矩阵Cij后,网络G有相同的节点数和边数。
目前稀疏度值的选择还不存在金标准。
因此,我们在一定范围内(5%~40%)每隔1%选取一个稀疏度,既使得所有的网络全连通,又保证其满足小世界属性。
如果稀疏度太小,可能使得边的数量太少而形成一个稀疏连接的图,存在孤立节点,不能全连通;如果稀疏度太大,可能使得边的冗余量太大,不满足小世界属性[20]。
至此完成大脑皮层厚度网络的构建(图1)。
1.3网络分析
完成大脑皮层厚度网络构建后,选用图论分析法计算网络的拓扑属性。
本文主要用到节点度、节点的聚类系数、节点的最短路径长度、节点的中介中心性这样一些拓扑属性。
小世界网络介于规则网络和随机网络之间,它既具有与规则网络类似的较高的聚类系数,又具有与随机网络类似的较短的最短路径长度(图2)。
在每个稀疏度下,计算出网络的平均最短路径长度Lp和平均聚类系数Cp。
然后,随机获得100个与实际网络具有相同节点数、度分布的随机网络。
Lr、Cr为这些随机网络的平均聚类系数和平均最短路径长度。
对四组对象的平均最短路径长度Lp、平均聚类系数Cp以及小世界特征λ=Lp/Lr和γ=Cp/Cr进行比较。
Hub节点是指网络中最为重要的节点,网络中许多其它节点之间的信息传输都需要经过该节点。
本文选用归一化的中介中心性BCi来定义hub节点。
网络的全局效率Eglob定义为网络中所有节点最短路径倒数的平均值,全局效率衡量全局信息在整个网络中传递的快慢。
网络脆弱性广泛用于定量测量网络节点的假设缺失对网络性能的影响。
2结果
四组对象的相关矩阵都比较复杂,但也有一定的相似性。
左右半球的同源脑区和位于同一半球的相邻脑区往往有较强的相关性。
根据得到的相关系数矩阵,需要选取阈值,确定稀疏度的范围。
当稀疏度S=9%时,第四组对象(65~70岁)的大脑网络出现了孤立的节点;而当S=10%时,四组对象的网络中均无孤立节点存在。
当S>30%,四组对象的小世界参数γ、λ的变化基本收敛。
因此稀疏度的范围被选定为10%≤S≤30%。
在这个范围内每隔1%计算一次四组对象的网络拓扑参数Cp、Lp、γ、λ,如图3所示。
在10%~30%的区间内,四组对象的Cp随着稀疏度的增加而增加,而Lp、γ、λ随稀疏度的增加而下降。
从图中我们可以看出55~60岁对象组的Cp值低于50~55岁对象组的Cp值;而60~65岁对象组Cp值高于55~60岁对象组的Cp值,却低于50~55岁对象组的Cp值;65~70岁对象组的Cp值低于60~65岁对象组的Cp值,高于55~60岁对象组的Cp值。
55~60岁对象组的Lp值低于50~55岁对象组的Lp值;60~65岁组的Lp值与65~70岁组的Lp值相近,均高于55~60岁对象组的Lp值。
当稀疏度增加时,γ值迅速下降,但λ值仅略有改变。
四组对象的σ=γ/λ值随着稀疏度的增加而减少,反映了小世界属性的减弱。
四组对象的γ值大小关系为:
50~55岁对象组>60~65岁对象组>65~70岁对象组>55~60对象组>1。
四组对象的λ值随着稀疏度的增加而接近于1,其大小关系为:
50~55岁对象组>60~65岁对象组,65~70岁对象组与55~60对象组λ值相近,四组对象的λ≈1。
在稀疏度10%≤S≤20%范围内,对四组对象的Cp、Lp、γ、λ进行单因素方差分析(One-WayANOVA),结果如图4所示。
对于Cp而言,四组对象方差齐性检验相伴概率为0.027,各组总体方差不相等。
ANOVA结果(F(3,40)=34.587,P<0.001)显示,四组对象间存在显著性差异。
DunnettT3非参数检验结果显示除60~65岁对象组和65~70岁对象组外,其它组两两之间均存在显著性差异。
对于平均最短特征路径长度Lp,四组对象间均不存在显著性差异(F(3,40)=0.17,P>0.05)。
对于小世界网络属性γ而言,方差齐性检验相伴概率为0.047,各组总体方差不相等,ANOVA结果(F(3,40)=5.509,P<0.05)显示四组对象间存在显著性差异。
DunnettT3非参数检验结果显示50~55岁对象组和55~60岁对象组间存在显著性差异(P=0.025)。
而对于λ而言,方差齐性检验相伴概率为0.015,各组总体方差不相等。
ANOVA分析结果(F(3,40)=6.528,P<0.05)显示,四组对象间存在显著性差异。
DunnettT3非参数检验结果显示50~55岁对象组与55~60岁对象组、55~60岁对象组与65~70岁对象组的相伴概率分别为0.012、0.005,两两之间存在显著性差异。
同理,在稀疏度10%≤S≤30%范围内,对四组对象的网络拓扑参数Cp、Lp、γ、λ进行ANOVA分析,结果如图5所示。
与稀疏度10%≤S≤20%相比,小世界网络属性λ组间不存在显著性差异。
这可能是由于随着稀疏度的增加,大脑网络的小世界属性逐渐减弱,致使其随着年龄增长的所发生的改变不是很明显。
这些结果意味着皮层网络的小世界参数结构随年龄变化而发生了明显改变。
为了比较不同年龄段对象的大脑皮层厚度网络hub节点的差异,本文在稀疏度10%下对所有网络进行二值化处理。
在该稀疏度下,大脑网络各节点全连通并且具有小世界属性,而且假阳性路径的数量最少。
如果节点的归一化的中介中心性BCi值大于mean+2SD,则该节点为网络中的hub节点,表2为网络中的hub节点在不同对象组的变化趋势。
这些脑区中有的脑区随着年龄的增长由非hub节点转换为hub节点,有的脑区随着年龄的增长由hub节点转换为非hub节点。
该结果与Zhu等[20]发现中年人与老年人在基于灰质体积构建的结构网络中,hub节点存在较大差异类似。
稀疏度为10%时计算四组对象构建的标准化的网络脆弱性并对其进行统计分析,结果如图6所示。
四组对象方差齐性检验相伴概率为0.000,小于显著性水平0.05,因此认为各个组总体方差是不相等的,ANOVA结果显示(F(3,396)=211.968,P<0.001),说明四组对象间存在显著性差异,DunnettT3非参数检验结果显示50~55岁对象组与60~65岁对象组、50~55岁对象组与65~70岁对象组、55~60岁对象组与60~65岁对象组、55~60岁对象组与65~70岁对象组的相伴概率分别为0.000、0.000、0.000、0.001、0.000,均小于显著性水平0.05,说明两两之间存在显著性差异。
3讨论
我国在未来几十年所面临的社会老龄化问题是前所未有的重大挑战,与之相应的脑老化及其相关疾病也就成为人们关注的焦点之一。
人脑是一个高效复杂的“小世界”网络,不同的状态或疾病都会导致网络属性异常,大脑老化也不例外。
从脑网络的角度研究大脑老化进程可以帮助我们了解大脑网络随年龄的变化,以便于未来制定针对性地相应的策略,为减轻老龄化社会做出贡献。
4结论
在本研究中,我们采用MRI皮质厚度测量显示了大型脑结构网络与年龄的相关变化。
主要结论如下:
①小世界网络特性随年龄增长而发生变化;②网络中心节点随年龄增长而发生变化。
这些网络特性随年龄而变化的基本机制目前尚不清楚,我们认为这可能反映了认知储备对于大脑萎缩所造成的网络效率下降的补偿作用;③网络中心节点随年龄增长对网络的贡献呈增大趋势,移除中心节点对标准化的网络脆弱性的影响在50~60岁间和60~70岁间存在显著不同。
随年龄增加,脑网络变得更加脆弱。
对于T1结构MRI而言,目前研究仍在集中在群体数据,个体网络构建及个体差异分析仍为盲点。
未来的网络构建应考虑如何体现个体差异,这将在临床应用中有着更为重要的价值。
另外,多模态脑连接组分析是脑网络分析未来研究的一个发展方向。
来自结构磁共振图像、弥散磁共振图像、功能磁共振图像等多种模式的影像数据组合会帮助我们从新的视角研究人类人脑。
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