DNAStar中文使用说明书.pdf
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DNAStar中文使用说明书.pdf
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/DNAStarDNAStar中文使用说明书中文使用说明书GETTINGSTARTEDIntroductoryTouroftheLASERGENESystemMAY2001生物秀下载频道生物秀下载频道专业资源下载平台专业资源下载平台http:
/DNASTAR,Inc.Allrightsreserved.Reproduction,adaptation,ortranslationwithoutpriorwrittenpermissionisprohibited,exceptasallowedunderthecopyrightlawsorwiththepermissionofDNASTAR,Inc.SixthEdition,May2001PrintedinMadison,Wisconsin,USATrademarkInformationDNASTAR,Lasergene,Lasergene99,SeqEasy,SeqMan,SeqManII,EditSeq,MegAlign,GeneMan,Protean,MapDraw,PrimerSelect,GeneQuest,GeneFont,andtheMethodCurtainaretrademarksorregisteredtrademarksofDNASTAR,Inc.MacintoshisatrademarkofAppleComputers,Inc.WindowsisatrademarkofMicrosoftCorp.ABIPrism373,377and3700areregisteredtrademarksofAppleraCorp.,ALFisaregisteredtrademarkofPharmaciaBiotechA.B.,MacVertor.andGCG.areregisteredtrademarksofPharmacopeia,Inc.Disclaimer&LiabilityDNASTAR,Inc.makesnowarranties,expressedorimplied,includingwithoutlimitationtheimpliedwarrantiesofmerchantabilityandfitnessforaparticularpurpose,regardingthesoftware.DNASTARdoesnotwarrant,guaranty,ormakeanyrepresentationregardingtheuseortheresultsoftheuseofthesoftwareintermsofcorrectness,accuracy,reliability,currentness,orotherwise.Theentireriskastotheresultsandperformanceofthesoftwareisassumedbyyou.Theexclusionofimpliedwarrantiesisnotpermittedbysomestates.Theaboveexclusionmaynotapplytoyou.InnoeventwillDNASTAR,Inc.andtheirdirectors,officers,employees,oragents(collectivelyDNASTAR)beliabletoyouforanyconsequential,incidentalorindirectdamages(includingdamagesforlossofbusinessprofits,businessinterruption,lossofbusinessinformationandthelike)arisingoutoftheuseof,ortheinabilitytousethesoftwareevenifDNASTARInc.hasbeenadvisedofthepossibilityofsuchdamages.Becausesomestatesdonotallowtheexclusionorlimitationofliabilityforconsequentialorincidentaldamages,theabovelimitationsmaynotapplytoyou.DNASTAR,Inc.reservestherighttorevisethispublicationandtomakechangestoitfromtimetotimewithoutobligationofDNASTAR,Inc.tonotifyanypersonororganizationofsuchrevisionorchanges.Thescreenandotherillustrationsinthispublicationaremeanttoberepresentativeofthosethatappearonyourmonitororprinter.生物秀下载频道生物秀下载频道专业资源下载平台专业资源下载平台http:
/在苹果机(Macintosh)(Macintosh)上的安装与升级05通过因特网升级0606软件安装0707网络安装0808疑难解答1212在PC机(Windows)上安装与升级1177通过因特网升级1188软件安装1919从EditSeqEditSeq开始21从GeneQuestGeneQuest开始31从MapDrawMapDraw开始44从MegAlignMegAlign开始54从PrimerSelectPrimerSelect开始65从ProteanProtean开始78从SeqManIISeqManII开始89生物秀下载频道生物秀下载频道专业资源下载平台专业资源下载平台http:
/通过因特网升级通过因特网升级必备条件必备条件66下载升级程序下载升级程序66软件安装软件安装必备条件必备条件77从从CD安装安装Lasergene77网络安装网络安装必备条件必备条件88定义定义88DongleDongle安装安装1010服务器服务器安装安装1010终端机终端机安装安装1111疑难解答疑难解答系统配置冲突及网络问题系统配置冲突及网络问题1212解决网络问题的其他工具解决网络问题的其他工具1313授权错误报告授权错误报告1414程序使用及更多的授权信息程序使用及更多的授权信息1515生物秀下载频道生物秀下载频道专业资源下载平台专业资源下载平台http:
/如果您以前已经安装了如果您以前已经安装了Lasergene而且目前有升级和服务联系而且目前有升级和服务联系,您,您就可以通过英特网来升级您现有的版本,就可以通过英特网来升级您现有的版本,各种模块各种模块(module)都是以都是以自解压形式自解压形式存储的,存储的,你可以选择性的下载安装。
你可以选择性的下载安装。
必备条件必备条件您的用户名和会员号是必需的,您的用户名和会员号是必需的,可以在安装盘上找到可以在安装盘上找到。
程序升级程序升级备份您已有的备份您已有的Lasergene,找到您要升级的程序找到您要升级的程序,并把它转移到备份并把它转移到备份的文件夹中的文件夹中。
连接到连接到DNAstar网站的主页网站的主页(http:
/),从从菜单中的菜单中的Customers中点击中点击LasergeneUpdates点点,安提示输入密码安提示输入密码和用户名和用户名(与会员名相同与会员名相同),),这样就会打开下载页面这样就会打开下载页面,找到找到Macintosh软件(软件(MacintoshSoftware),就可以下载您想要的模块了),就可以下载您想要的模块了。
模块下载完毕以后,模块下载完毕以后,双击文件将其解压缩到已经安装的双击文件将其解压缩到已经安装的DNAstar文件文件夹中替换旧的模块文件。
夹中替换旧的模块文件。
用用MacintoshFinder打开打开Lasergene浏览器浏览器,找到,找到DNAstar文件文件夹夹,从从FILEMENU选择选择UpdateApplications,然后插入安装盘然后插入安装盘,等待等待升级完毕。
升级完毕。
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/本节介绍若何从本节介绍若何从CD在苹果机在苹果机(Macintosh)上安装上安装Lasergene。
注注意安装是尽量关闭所有其它程序以保证安装顺利进行意安装是尽量关闭所有其它程序以保证安装顺利进行。
必备条件必备条件一张个人的一张个人的Lasergene安装盘安装盘;一张一张Lasergene软件光碟;软件光碟;足够的硬盘空间和内存:
足够的硬盘空间和内存:
至少30至少30Mb的硬盘的硬盘,32Mb的的RAM。
从光盘安装从光盘安装Lasergene插入安装盘和安装光盘,插入安装盘和安装光盘,双击图标双击图标,则出现下面的窗口,则出现下面的窗口,点击继点击继续则出现安装窗口。
续则出现安装窗口。
窗口中有两种安装选择:
窗口中有两种安装选择:
简易安装和一般安装简易安装和一般安装。
简易安装可以运行于简易安装可以运行于68K-68K-familyandPowerfamilyandPowerMacintoshes。
Macintoshes。
而一般安装可以安装工作站文件而一般安装可以安装工作站文件、执行文件和样品资料,执行文件和样品资料,我们推荐使用我们推荐使用简易安装,简易安装,如果使用一般安装可以节省5如果使用一般安装可以节省5Mb的空间。
的空间。
注意安装完毕后注意安装完毕后,要重新启动计算机,要重新启动计算机。
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/Lasergene网络系统是可以运行于局域网计算机上的软件。
网络系统是可以运行于局域网计算机上的软件。
他有两部他有两部分组成分组成:
一是资料服务器:
一是资料服务器,服务器要有较大的硬盘和较高的运行速度;,服务器要有较大的硬盘和较高的运行速度;二是与服务器相连的终端机。
后者通过一个称为二是与服务器相连的终端机。
后者通过一个称为dongle的的Lasergene硬盘设备相连进行管理。
硬盘设备相连进行管理。
必备条件必备条件安装磁盘(安装磁盘(服务器版服务器版)客户端磁盘客户端磁盘,包括安装盘,包括安装盘(终端版)(终端版)和和Disk1(终端版)。
终端版)。
Lasergene软件光盘软件光盘DNAstar网络用网络用dongle盘足够的硬盘空间和内存:
盘足够的硬盘空间和内存:
服务器至少30服务器至少30Mb的硬盘,的硬盘,8Mb的的RAM。
终终端机至少1端机至少1Mb的硬盘,的硬盘,32Mb的的RAM。
定义定义在安装在安装Lasergene网络系统之前要熟悉以下术语:
网络系统之前要熟悉以下术语:
?
应用程序:
应用程序:
指指EditSeq,GeneMan,GeneQuest,MapDraw,MegAlign,PrimerSelect,Protean,andSeqManII。
?
应用程序服务器应用程序服务器:
是指存储应用程序的电脑:
是指存储应用程序的电脑,通常与,通常与dongle服务服务器是同一个服务器,器是同一个服务器,但也可以不同,但也可以不同,当在局部硬盘上安装网络程序当在局部硬盘上安装网络程序时时,也可以在同一个网络系统中同时存在多个不同的应用程序服务,也可以在同一个网络系统中同时存在多个不同的应用程序服务器器,而且应用程序服务器不一定是苹果机,而且应用程序服务器不一定是苹果机,储存应用程序的机器也储存应用程序的机器也生物秀下载频道生物秀下载频道专业资源下载平台专业资源下载平台http:
/运行的最小软件部分小软件部分,它包括以下在内:
,它包括以下在内:
LicenseKeeper,LicenseKeeper,NavigatorNavigator,和,和系系统资源统资源。
?
终端机终端机:
这这可以可以是任何不作为DongleServer的网络上的机器是任何不作为DongleServer的网络上的机器。
终端终端机是任何最少穿过终端机安装的机器机是任何最少穿过终端机安装的机器,这样这样是使得Lasergene应用程是使得Lasergene应用程序运行需要的最少、序运行需要的最少、最低限度的软件最低限度的软件。
?
DongleDongle:
Dongle是网络版Lasergene需要的Dongle是网络版Lasergene需要的硬件硬件装置装置。
每个网络系统每个网络系统都需要单独都需要单独的Dongle。
的Dongle。
dongle是dongle是末端上带末端上带1个1个短的短的电缆电缆的小的矩形的的小的矩形的装置。
装置。
有2有2不同的种类的dongles不同的种类的dongles:
一种是在计算机背后可与调制解:
一种是在计算机背后可与调制解调器端口连起来调器端口连起来,有有9个pin9个pin插头插头;另一种有另一种有4个别针阳插头,4个别针阳插头,连接鼠连接鼠标标和键盘。
和键盘。
?
DongleDongle服务器服务器:
这是装有Dongle的机器:
这是装有Dongle的机器,它肯定是最少穿过终端机,它肯定是最少穿过终端机安装的苹果计算机,安装的苹果计算机,这机器应该这机器应该始终保持运行。
始终保持运行。
?
NavigatorNavigator:
是为了更简单的进行Lasergene应用设计的工具。
:
是为了更简单的进行Lasergene应用设计的工具。
在必在必要的情况下要的情况下,Navigator将自动安装网络组件,Navigator将自动安装网络组件,而且为网络安装诊断而且为网络安装诊断工具。
工具。
?
LicenseLicenseKeeperKeeper:
和:
和DongleDongle交流的持有人的系统扩展交流的持有人的系统扩展部分部分。
它。
它告诉告诉dongledongle哪个应用被开始哪个应用被开始,这样,dongle,这样,dongle才允许末个机器程序运行。
才允许末个机器程序运行。
?
服务器安装服务器安装:
指:
指Lasergene软件的完整安装Lasergene软件的完整安装,包括应用程序、,包括应用程序、LicenseKeeperLicenseKeeper、Navigator和、Navigator和系统资源系统资源。
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/安装使使Lasergene网络Lasergene网络版能够运行的版能够运行的第一个操作就是第一个操作就是安装安装dongledongle。
在你安装。
在你安装之前,之前,请检查你的dongle是否有9请检查你的dongle是否有9-别针连接器-别针连接器(connector)或4connector)或4-别针连-别针连接器(接器(connector)。
connector)。
?
关闭你打算关闭你打算装dongle服务器那台装dongle服务器那台苹果计算机苹果计算机的电源。
的电源。
?
如果你的dongle有如果你的dongle有9-别针连接器9-别针连接器(connector)(connector),把它连接到,把它连接到你的计你的计算机调制解调器算机调制解调器的端口上。
的端口上。
调制解调器端口是一个有调制解调器端口是一个有9个外置接口的9个外置接口的设备,设备,位于位于你的苹果计算机的后面的展示板上,你的苹果计算机的后面的展示板上,电话听筒图标的附电话听筒图标的附近近。
?
如果你的dongle有如果你的dongle有4-别针连接器4-别针连接器,从键盘断开鼠标,从键盘断开鼠标,把dongle接在把dongle接在键盘上键盘上,接着,接着,把你的鼠标接在把你的鼠标接在dongledongle上。
上。
?
重新启动苹果计算机重新启动苹果计算机。
?
如果你的dongle被接在苹果计算机上,如果你的dongle被接在苹果计算机上,你必须按照dongle服务器那你必须按照dongle服务器那样样进行进行软件安装软件安装。
如果你。
如果你打算将这机器作为打算将这机器作为文件服务器,文件服务器,请安请安服务服务器安装器安装的方法安装。
的方法安装。
如果你不打算将这机器作为文件服务器,如果你不打算将这机器作为文件服务器,请安请安终端机安装的方法安装。
终端机安装的方法安装。
在对dongle服务器在对dongle服务器施行成施行成功功的软件安装之后的软件安装之后,在,在启动时应该出现右面的启动时应该出现右面的服务器服务器图图标标。
服务器安装服务器安装(ServerInstallation(ServerInstallation)?
这个安装和这个安装和在第在第5页上所描述的5页上所描述的软件软件安装过程基本相同的安装过程基本相同的。
由于大部由于大部分的网络包括机器很多的不同的种类的(68K,分的网络包括机器很多的不同的种类的(68K,和PowerMacintosh和PowerMacintosh生物秀下载频道生物秀下载频道专业资源下载平台专业资源下载平台http:
/易安装装。
?
在完成软件安装之后在完成软件安装之后,如右图操作共如右图操作共享享Lasergene应用Lasergene应用程序程序文件夹,文件夹,这样,这样,其他的网络用户其他的网络用户才可以使用。
才可以使用。
如果你如果你不能确定怎样操作,不能确定怎样操作,请和你的网络管请和你的网络管理员联络。
理员联络。
终端机安装(ClientInstallation终端机安装(ClientInstallation)?
终端机安装必须在全部需要对Lasergene服务器操作终端机安装必须在全部需要对Lasergene服务器操作的机器,的机器,但不但不是是文件服务器的机器。
文件服务器的机器。
?
插入安装磁盘终端机版本插入安装磁盘终端机版本,然后按照在第5,然后按照在第5页上页上软件安装软件安装的方法安的方法安装装。
?
随后通过苹果机随后通过苹果机菜单的选择命令将文件服务器和菜单的选择命令将文件服务器和终端机相连。
终端机相连。
一些一些网络可以使用其他的方法进行相连。
网络可以使用其他的方法进行相连。
如果这步你有问题,如果这步你有问题,请和你的请和你的网络管理员联络网络管理员联络。
?
从从终端机上的DNASTAR终端机上的DNASTAR文件夹中运行浏览器文件夹中运行浏览器。
?
从文件菜单从文件菜单,选择寻找应用程序,选择寻找应用程序,你应该收到如下信息:
,你应该收到如下信息:
全部应程全部应程序用都被浏览器找到了。
序用都被浏览器找到了。
现在就可以从文件服务器运行Lasergene应用程序了现在就可以从文件服务器运行Lasergene应用程序了。
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/系统配置冲突系统配置冲突一些系统配置可能会在安装过程冲突一些系统配置可能会在安装过程冲突,如果你不能从,如果你不能从LasergeneLasergene光盘成光盘成功地安装,功地安装,可以关上不必要的配置:
可以关上不必要的配置:
?
用用计算机控制板上的配置计算机控制板上的配置管理器管理器关闭关闭任何不必要的扩展程序。
任何不必要的扩展程序。
?
或重新启动或重新启动你的机器你的机器,继续安装,继续安装。
网络疑难网络疑难找不到找不到dongledongle服务器是服务器是网络问题中最常见的网络问题中最常见的问题问题。
当你开始运行。
当你开始运行DNASTARDNASTAR应用应用程序时,程序时,你会遇到这问题,你会遇到这问题,提示信息显示:
提示信息显示:
DNASTARDNASTAR许可服许可服务器没有应答,务器没有应答,请再请再试一次。
可能有以下几个原因:
试一次。
可能有以下几个原因:
?
是否装有dongle的计算机被关闭是否装有dongle的计算机被关闭,如果是重启dongle机器即可。
,如果是重启dongle机器即可。
?
是否dongle没有接在苹果计算机上,或者不在调制解调器端口或鼠是否dongle没有接在苹果计算机上,或者不在调制解调器端口或鼠标接口标接口,按照第,按照第8页DongleInstallation命令在8页DongleInstallation命令在苹果计算机上重新苹果计算机上重新安装dongle。
安装dongle。
记住在除掉或者插入dongle之前先记住在除掉或者插入dongle之前先关闭计算机。
关闭计算机。
?
如果你的dongle被接在如果你的dongle被接在IIfx,Quadra900或IIfx,Quadra900或Quadra950等机子上,Quadra950等机子上,你你不仅不仅需要需要重新安装重新安装,还要进行如下操作:
,还要进行如下操作:
?
从菜单从菜单中选中选择择ControlPanels中的中的SerialSwitch双击双击,就会出现右面的窗,就会出现右面的窗口。
口。
?
将将Faster换成换成Compatible。
然后重启计算然后重启计算机机。
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/booting期间里不是别期间里不是别调制解调器端口的调制解调器端口的记号。
记号。
用LicenseKeeper用LicenseKeeper按下面的方法寻找按下面的方法寻找调制解调器端口:
调制解调器端口:
?
启动Navigator。
启动Navigator。
?
按按OptionOptionNETWORKMENUNETWORKMENUSetLicenseKeeper的顺序打SetLicenseKeeper的顺序打开右边的LicenseKeeper开右边的LicenseKeeper对话对话框框。
?
把把DongleDelay参数放到DongleDelay参数放到3秒上。
3秒上。
?
单击LicenseKeeper单击LicenseKeeper,接着Done,接着Done。
?
重启苹果计算机重启苹果计算机。
?
如果问题还没解决,如果问题还没解决,和DNASTAR联络。
和DNASTAR联络。
其他解决网络问题其他解决网络问题方法方法要了解您的计算机和全部可通过网络运行DNASTAR要了解您的计算机和全部可通过网络运行DNASTAR的dongle的dongle服务器服务器,选选择择NETWORKMENU中的NETWORKMENU中的DiagnoseLicenseKeeperDiagnoseLicenseKeeper。
计算机将告诉您。
计算机将告诉您是否是否dongledongle被安装被安装到你的计算到你的计算机上,机上,是否是否存在存在LicenseKeeperLicenseKeeper系统系统配置配置。
同时显示LicenseKeeper同时显示LicenseKeeper站站点识别和版本编号点识别和版本编号。
无论无论你你的计算机的授权状态如何的计算机的授权状态如何,生物秀下载频道生物秀下载频道专业资源下载平台专业资源下载平台http:
/许可服务器报告在网络地带附近形告在网络地带附近形成,成,可显示全部对你的网络应答的dongle服务器的可显示全部对你的网络应答的dongle服务器的用户名用户名,站点识别和,站点识别和版本编号。
版本编号。
通常通常,你的,你的LANLAN包括单一的dongle服务包括单一的dongle服务器器,但是但是,大的网络上可以有几个大的网络上可以有几个。
如果你的计算机被接在大的LAN上,如果你的计算机被接在大的LAN上,打
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