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融合蛋白标签
在蛋白质功能及结构研究过程中,研究得首要任务就就是利用多种方法获得纯化得具有完整结构及生物学功能并能够正确折叠得高度纯化蛋白质。
除了蛋白质得研究,具有特定生物活性得高价值蛋白质得生产也需要对蛋白质产品进行纯化。
因此,科研人员与工业生产往往大量采用多种多样得表达系统来获得高表达得蛋白质,对其纯化后进行研究或加工,这些表达系统包括原核表达系统、酵母菌表达系统、昆虫动物细胞表达系统、真核细胞表达系统等。
如何将系统中表达得目标蛋白质与其她蛋白分离,一直就是表达纯化中得一个重点.为了克服从复杂样品中纯化单一蛋白质这种困难,科学家利用生物物质,特别就是酶与抗体等蛋白质,具有识别某种特定物质并与该物质分子特异性结合得能力,利用生物分子间得这种特异性结合能力而形成得亲与纯化技术.亲与标签纯化技术已广泛应用于蛋白质,特别就是重组蛋白得分离纯化中。
在重组蛋白得亲与纯化中,利用基因工程技术,将经过改造优化得亲与标签与目标蛋白融合表达,通过一步简单快速得亲与层析,直接获得纯度较高得重组融合蛋白,已成为重组蛋白纯化得一个通用方法,具有结合特异性高、纯化步骤简便、纯化条件温与、适用性广泛等优点,为蛋白质得有效纯化提供了一条解决得途径,广泛应用于蛋白质结构与功能得研究及重组蛋白纯化工艺得开发中。
自从20世纪70年代中期融合标签技术出现以来,亲与标签已成为一种重组蛋白纯化十分有效得工具,具有结合特异性高、纯化条件温与、纯化步骤简便、适用性广泛等显著优势。
通常,亲与标签定义为对特定得生物或化学配基具有高度亲与力得一段氨基酸序列。
到目前为止,已经出现了种类众多、功能各异、用途多样得亲与标签,极大地促进了对重组蛋白得有效纯化。
根据自身分子量大小得不同,亲与标签可以分为两大类:
一类就是结合固定化配基得短肽标签,如His—tag、FLAG-tag、Strep-tagⅡ等;另一类就是识别小分子配基得蛋白标签,如GST、MBP等。
短肽标签:
His-tag:
His标签就是目前高通量蛋白纯化最普遍使用得亲与标签,广泛用于多种重组蛋白在各种表达系统得表达与纯化中。
His标签一般为5~15个组氨酸,被认为就是重组蛋白纯化得首选标签,具有以下优点:
(1)位于目标蛋白N端得His标签与细菌得转录翻译机制相互兼容,利于蛋白得表达;
(2)His标签几乎不影响目标蛋白得理化性质;(3)His标签很小,不会改变目标蛋白得可溶性;(4)His标签在目标蛋白结晶后对蛋白结构几乎没有影响;(5)采用固定化金属离子亲与层析纯化His标签融合蛋白时,其操作非常简便.基于上述优点,几乎所有得大型结构基因组研究中心都把纯化His标签融合蛋白得固定化金属离子亲与层析(immobilizedmetal—ionaffinitychromatography,IMAC)作为主要得蛋白纯化方法。
然而,并不就是所有得蛋白质都可以与His标签融合后,采用固定化金属离子亲与层析分离纯化。
宿主蛋白中含有半胱氨酸及天然发生得组氨酸丰富区域,在固定化金属离子亲与层析时可能会导致其她蛋白得非特异性结合;目标蛋白含有金属离子,一般也不采用His标签与固定化金属离子亲与层析。
FLAG—tag:
除了His标签外,另一个广泛使用得小分子短肽标签就是FLAG标签。
FLAG标签就是由8个氨基酸(DYKDDDDK)组成得一个短肽,分子量很小,因而不会遮盖融合蛋白中其她得蛋白表位与结构域,也不会改变融合蛋白得功能、分泌或运输。
该标签具有天然得亲水特性,很容易定位于融合蛋白得表面,便于利用抗体检测;同时含有一个肠激酶切割位点(DDDK),可以利用肠激酶切除标签。
FLAG标签有3个特异性得单克隆抗体,分别为M1单抗、M2单抗、M5单抗。
FLAG短肽合成成本较高,不适用于大规模纯化,且需要额外步骤除去结合在层析介质上得短肽。
Strep—tagⅡ:
与His-tag、FLAG-tag相似,Strep-tagⅡ也就是一个小分子得短肽标签,广泛用于多种目标蛋白在原核表达系统、哺乳动物细胞表达系统等得表达与纯化中。
在自然界中,链霉亲与素(streptavidin)与生物素(biotin)之间存在着非常强烈得非共价相互作用,其生物学上得解离常数极低;即使生物素与其她蛋白质共价结合之后,两者仍可以相互作用。
基于这两者之间得强烈相互作用,运用一系列蛋白质工程手段,通过对短肽文库得筛选,第一个链霉亲与素结合肽应运而生,即Strep-tag,极大地方便了重组蛋白得一步快速亲与纯化。
然而,Strep-tag与链霉亲与素结合时需要一个自由得羧基末端,因而该标签只能位于目标蛋白得C端,限制了它得应用范围。
在Strep—tag得基础上,通过对合成短肽得筛选,获得了一个与其相似、由8个氨基酸(WSHPQFEK)组成得链霉亲与素结合肽,即Strep—tagⅡ,可以位于融合蛋白得任意位置,从而弥补了Strep-tag得不足。
同时,通过对链霉亲与素特定氨基酸得定向突变,获得了与Strep-tagⅡ具有更高亲与力得亲与介质Strep—tactin,在Strep—tagⅡ融合蛋白得亲与纯化中表现出良好得纯化效果,且蛋白质产量较高,所需成本适中。
Strep-tagⅡ系统得纯化条件比较宽泛,在普通缓冲液下就可与strep-Tactin层析介质结合,使用2、5mmol/L得脱硫生物素就可将Strep—tagⅡ融合蛋白洗脱下来,螯合剂、去污剂、还原剂及高达1mol/L得盐均可加入到缓冲液中。
此外,Strep—tagⅡ在纯化过程中不依赖金属离子,十分适合含金属离子蛋白质得纯化。
蛋白标签:
GST:
GST标签由211个氨基酸组成,大小约为26kDa,就是目前广泛用于重组蛋白融合表达与亲与纯化得一种蛋白标签。
大量得表达实验发现,外源蛋白在大肠杆菌表达系统中过量表达时,常会以包涵体得形式形成不溶性得聚合体,大大降低了可溶性重组蛋白得产量,增加了后续蛋白分离纯化得难度。
然而,在融合GST标签进行原核表达得过程中发现,原 本用于亲与纯化得GST标签能在一定程度上增大融合蛋白得可溶性,使融合蛋白以可溶形式存在于细胞质中,不仅促进了目标蛋白得正确折叠,提高了蛋白产量,而且有助于后续得蛋白纯化。
除了增大融合蛋白得可溶性之外,GST标签还具有高效得翻译起始、纯化条件温与、亲与树脂成本相对低廉等显著优点,成为重组蛋白融合表达经常使用得亲与标签。
MBP:
MBP标签由大肠杆菌K12得malE基因编码得396个氨基酸组成,大小约为40kDa,就是除了GST标签之外又一个很好得增大融合蛋白可溶性得蛋白标签.MBP标签能够增大在原核表达系统中过量表 达得融合蛋白得可溶性,提高其表达量,已在多个表达实验中得到确认。
研究发现,当改变MBP“开放”与“关闭”构象之间得平衡时,MBP增大融合蛋白可溶性得能力将受到明显影响,表明MBP增大融合蛋白可溶性得特性就是由其“开放”构象所介导;同时,对MBP配基结合间隙中保守得疏水性氨基酸残基进行定向突变,MBP表现出相似得表型,表明这个配基结合间隙在MBP增大融合蛋白可溶性得机制中具有一定得作用.
然而,从蛋白纯化得角度来瞧,MBP标签并不就是一个最有效得亲与标签;在某些情况下,MBP标签并不能特异性地与亲与树脂有效结合,亲与层析后融合蛋白得纯度也并不合适。
自从上世纪70年代中期亲与标签融合技术出现以来,多种多样得短肽或蛋白亲与标签极大地方便了外源表达重组蛋白得分离与蛋白质复合体得纯化,已成为蛋白质研究领域不可或缺得工具。
一般而言,一个完美得亲与标签应该具备以下特性:
(1)能够用于纯化任何表达宿主或表达系统所表达得重组蛋白;(2)可以位于目标蛋白得任意位置而不影响其结构;(3)增大目标蛋白得可溶性,促进其正确折叠,提高蛋白表达量;(4)便于重组蛋白得检测。
目前,商品化得亲与标 签已具备其中诸多特性,但性能更加优越、纯化效果更加显著得亲与标签仍需不断寻找与开发.
重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。
特别就是体内功能研究与蛋白质得大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体。
美国GeneCopoeia得蛋白表达载体按照表达宿主得不同新推出3类,分别为表达宿主为大肠杆菌,哺乳动物细胞得,以及慢病毒载体,宿主可以为哺乳动物细胞与原代细胞。
除了必要得复制与筛选得元件,协助表达与翻译得元件外,本文将各类载体分别按照功能标签得不同确定种类并将个标签得功能初步介绍如下:
His6:
His6就是指六个组氨酸残基组成得融合标签,可插入在目得蛋白得C末端或N末端。
当某一个标签得使用,一就是能构成表位利于纯化与检测;二就是构成独特得结构特征(结合配体)利于纯化。
组氨酸残基侧链与固态得镍有强烈得吸引力,可用于固定化金属螯合层析(IMAC),对重组蛋白进行分离纯化。
使用His-tag有下面优点:
1、标签得分子量小,只有~0、84KD,而GST与蛋白A分别为~26KD与~30KD,一般不影响目标蛋白得功能;
2、His标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在得条件下或变性条件下纯化,前者在纯化疏水性强得蛋白得到应用,后者在纯化包涵体蛋白时特别有用,用高浓度得变性剂溶解后通过金属螯与亲与层析去除杂蛋白,使复性不受其它蛋白得干扰,或进行金属螯与亲与层析复性;
3、His标签融合蛋白也被用于蛋白质—蛋白质、蛋白质-DNA相互作用研究;
4、His标签免疫原性相对较低,可将纯化得蛋白直接注射动物进行免疫制备抗体;
5、可应用于多种表达系统,纯化得条件温与;
6、可以与其它得亲与标签一起构建双亲与标签。
Flag:
Flag标签蛋白为编码8个氨基酸得亲水性多肽(DYKDDDDK),同时载体中构建得Kozak序列使得带有FLAG得融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高。
FLAG作为标签蛋白,其融合表达目得蛋白后具有以下优点:
1、FLAG作为融合表达标签,其通常不会与目得蛋白相互作用并且通常不会影响目得蛋白得功能、性质,这样就有利用研究人员对融合蛋白进行下游研究.
2、融合FLAG得目得蛋白,可以直接通过FLAG进行亲与层析,此层析为非变性纯化,可以纯化有活性得融合蛋白,并且纯化效率高。
3、FLAG作为标签蛋白,其可以被抗FLAG得抗体识别,这样就方便通过WesternBlot、ELISA等方法对含有FLAG得融合蛋白进行检测、鉴定.
4、融合在N端得FLAG,其可以被肠激酶切除(DDDK),从而得到特异得目得蛋白.因此现FLAG标签已广泛得应用于蛋白表达、纯化、鉴定、功能研究及其蛋白相互作用等相关领域。
MBP:
MBP(麦芽糖结合蛋白)标签蛋白大小为40kDa,由大肠杆菌K12得malE基因编码。
MBP可增加在细菌中过量表达得融合蛋白得溶解性,尤其就是真核蛋白。
MBP标签可通过免疫分析很方便地检测.有必要用位点专一得蛋白酶切割标签。
如果蛋白在细菌中表达,MBP可以融合在蛋白得N端或C端。
纯化:
融合蛋白可通过交联淀粉亲与层析一步纯化.结合得融合蛋白可用10mM麦芽糖在生理缓冲液中进行洗脱.结合亲与力在微摩尔范围。
一些融合蛋白在0、2%TritonX—100或0、25%Tween 20存在下不能有效结合,而其她融合蛋白则不受影响。
缓冲条件为pH7、0到8、5,盐浓度可高达1M,但不能使用变性剂.如果要去除MBP融合部分,可用位点特异性蛋白酶切除.
检测:
可用MBP抗体或表达得目得蛋白特异性抗体检测。
GST:
GST(谷胱甘肽巯基转移酶) 标签蛋白本身就是一个在解毒过程中起到重要作用得转移酶,它得天然大小为26KD。
将它应
用在原核表达得原因大致有两个,一个就是因为它就是一个高度可溶得蛋白,希望可以利用它增加外源蛋白得可溶性;另一个就是它可以在大肠杆菌中大量表达,起到提高表达量得作用。
GST融合表达系统广泛应用于各种融合蛋白得表达,可以在大肠杆菌与酵母菌等宿主细胞中表达。
结合得融合蛋白在非变性条件下用10mM还原型谷胱甘肽洗脱。
在大多数情况下,融合蛋白在水溶液中就是可溶得,并形成二体。
GST标签可用酶学分析或免疫分析很方便得检测。
标签有助于保护重组蛋白免受胞外蛋白酶得降解并提高其稳定性。
在大多数情况下GST融合蛋白就是完全或部分可溶得.
纯化:
该表达系统表达得GST标签蛋白可直接从细菌裂解液中利用含有还原型谷胱甘肽琼脂糖凝胶(Glutathionesepharose)亲与树脂进行纯化.GST标签蛋白可在温与、非变性条件下洗脱,因此保留了蛋白得抗原性与生物活性。
GST在变性条件下会失去对谷胱甘肽树脂得结合能力,因此不能在纯化缓冲液中加入强变性剂如:
盐酸胍或尿素等。
如果要去除GST融合部分,可用位点特异性蛋白酶切除。
检测:
可用GST抗体或表达得目得蛋白特异性抗体检测。
HA
HA标签蛋白,标签序列YPYDVPDYA,源于流感病毒得红细胞凝集素表面抗原决定簇,9个氨基酸,对外源靶蛋白得空间结构影响小,容易构建成标签蛋白融合到N端或者C端。
易于用Anti-HA抗体检测与ELISA检测.
c—Myc
C—Myc标签蛋白,就是一个含11个氨基酸得小标签,标签序列Glu—Gln-Lys—Leu-Ile—Ser-Glu—Glu-Asp-Leu,这11个氨基酸作为抗原表位表达在不同得蛋白质框架中仍可识别其相应抗体。
C—Myc tag已成功应用在Western—blot杂交技术、免疫沉淀与流式细胞计量术中,可用于检测重组蛋白质在靶细胞中得表达.
eGFP/eCFP/eYFP/mCherry
分别就是增强型绿色荧光蛋白/增强型黄绿色荧光蛋白/增强型黄绿色荧光蛋白/单体红色荧光蛋白,具有不同得激发波长发射波长为,均由野生型荧光蛋白通过氨基酸突变与密码子优化而来。
就eGFP而言,相对于GFP,其荧光强度更强、荧光性质更稳定.同时载体中构建得Kozak序列使得含有eGFP得融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高。
mCherry就是从DsRed演化来得性能最好得一个单体红色荧光蛋白,可以与GFP系列荧光蛋白共用,实现多色标记体内、外实验表明,mCherry在N端与C端融合外源蛋白时,荧光蛋白活性与被融合得目标蛋白功能相互没有明显影响。
这些荧光标签蛋白,其融合表达目得蛋白后具有以下优点:
1、不用破碎组织细胞与不加任何底物,直接通过荧光显微镜就能在活细胞中发出绿色荧光,实时显示目得基因得表达情况,而且荧光性质稳定,被誉为活细胞探针。
2、其自发荧光,不需用目得基因得抗体或原位杂交技术就可推知目得基因在细胞中得定位等情况。
3、同时细胞内得其它产物不会干扰标签蛋白检测,从而使其检测更显得快速、简便、灵敏度高而且重现性。
4、其低消耗、高灵敏度检测,十分适用于高通量得药物筛选。
因此现eGFP表达标签被广泛地应用于基团表达调控、转基因功能研究、蛋白在细胞中得功能定位、迁移变化及药物筛选等方面。
5、mCherry红色荧光蛋白在标记病毒颗粒,研究病毒与宿主细胞之间更有得天独厚得优势.如用mRFP或mCherry标记HIV病毒颗粒,研究H1V与宿主细胞问得相互作用以及HIV侵染宿主细胞得过程。
用mRFP标记慢病毒颗粒,研究慢病毒在小鼠体内得复制过程等。
荧光素酶
来源于生物体内得荧光素,常见得有萤火虫荧光素酶、海肾荧光素酶与Guassia荧光素酶.这些荧光素酶作为“报告蛋白”被用于分子生物学研究中,这种技术被称为报告基因检测法或萤光素酶检测法(LuciferaseAssay)。
跟普通融合蛋白标签不同,使用荧光素酶构建得报告基因可用作目得基因得定量分析。
因此常用于研究启动子、miRNA3'UTR克隆得功能与调控,因为它们对目得基因得调控可以就是渐变得,而不就是简单得开与关两种状态。
优点:
灵敏度高,检测幅度宽;不就是哺乳动物细胞内源性基因;重复性好;与HTS兼容等.萤火虫与海肾荧光素酶已经被广泛应用于协同报告并进行均一化研究。
由于它们都就是快速,容易与高灵敏得监测方法。
而且萤火虫与海肾荧光素
酶就是理想得双基因报告系统,因为它们来源于不同得生物进化方向,蛋白结构与底物差异都很大,在实验中不会产生相互影响。
基于荧光素酶得特性,我司研发提供得Secrete-Pair?
DualLuminescenceAssay Kit可用于分析双报告系统中Gaussia荧光素酶(GLuc)与分泌型碱性磷酸酶(SEAP)活性.GLuc与SEAP均为分泌型报告蛋白,无需裂解细胞即可便捷得从细胞培养液中取得样本,并对实验结果进行精准得实时分析。
AviTag
AviTag标签蛋白就是一个15个氨基酸得短肽,具有一个单生物素化赖氨酸位点,与已知天然可生物素化序列完全不同,可以加在目标蛋白得N端与C端.融合表达后,可被生物素连接酶生物素化,为了纯化重组蛋白选用低亲与性得单体抗生物素蛋白或抗生物素蛋白衍生物,除了用于蛋白质分离纯化,还用于蛋白质相互作用研究。
Avi Tag标签系统具有以下几大优点:
1、无论在体外或者体内,几乎所有得蛋白都可以在一个独特得AviTag位点轻易且有效地被生物素化;
2、生物素化就是通过酶与底物得反应来实现,反应条件相当温与而且标记得专一性极高;
3、生物素AviTag只有15个氨基酸,对蛋白空间结构得影响非常小.
SNAP-Tag
SNAP-Tag就是新一代得蛋白标签技术,不仅专一性极高而且稳定,最大得优点就是适用于多种环境下得蛋白质检测与纯化,如活细胞内、溶液中、或固态相(如SDS—PAGEgels)等。
SNAP-Tag就是从人得O6—甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移(O6—alkylguanine-DNA—alkyltransferase)获得。
无论体内还就是体外,SNAP—Tag都能与底物高特异性地共价结合,使蛋白标记上生物素或荧光基团(如荧光素与若丹明)。
SNAP所带得活性巯基位点接受了苯甲基鸟嘌呤所携带得侧链苯甲基基团,释放出了鸟嘌呤。
这种新得硫醚键共价结合使SNAP所带得目得蛋白携带上了苯甲基基团所带得标记物.苯甲基鸟嘌呤在生化条件下稳定,并且没有其她蛋白会与这类物质作用,所以SNAP标签反应就是高特异得。
检测:
生物素或各种颜色荧光得底物(如荧光素、若丹明)可渗透进入细胞,方便快捷地进行活细胞内SNAP—Tag融合蛋白得标记与检测。
它们也可特异性地标记大肠杆菌,酵母与哺乳动物等细胞抽提液或已经纯化得蛋白液中得SNAP-tag融合蛋白.
将纯化得或未纯化得SNAP-Tag融合蛋白与表面固定了苯甲基鸟嘌呤得基质混合,蛋白即可特异与底物作用,形成共价键,融合蛋白间接被固定在了基质表面上,可以达到更方便快捷地研究蛋白功能或纯化蛋白得目得。
HaloTag
HaloTag?
标签蛋白就是一种脱卤素酶得遗传修饰衍生物,可与多种合成得HaloTag?
配基有效地共价结合。
这个分子量为33KDa得单体蛋白能融合在重组蛋白得N端或C端,并在原核与真核系统中表达。
HaloTag?
配基就是小分子化学物,能够在体外或体内与HaloTag?
蛋白共价结合。
这些配基由两个关键组分组成:
(1)一个通用得HaloTag?
反应联结子,结合HaloTag?
蛋白;
(2)一个功能基团,例如荧光染料或亲与媒介。
能够共价与特异性结合多种合成得报告基团与亲与配基得特性,使得HaloTag?
蛋白能够用于检测与亲与结合或固相化固定目得蛋白。
SUMO
SUMO标签蛋白就是一种小分子泛素样修饰蛋白(Small ubiquitin—likemodifier),就是泛素(ubiquitin)类多肽链超家族得重要成员之一。
在一级结构上,SUMO与泛素只有18%得同源性,然而两者得三级结构及其生物学功能却十分相似。
研究发现SUMO可以作为重组蛋白表达得融合标签与分子伴侣,不但可以进一步提高融合蛋白得表达量,且具有抗蛋白酶水解以及促进靶蛋白正确折叠,提高重组蛋白可溶性等功能。
此外SUMO还有一项重要得应用,就就是可用于完整地切除标签蛋白,得到天然蛋白。
因为SUMO蛋白水解酶(我公司可提供)能识别完整得SUMO标签蛋白序列,并能高效地把SUMO从融合蛋白上切割下来.切除SUMO后,经过亲与层析,去除标签蛋白部分,就得到与天然蛋白一样得重组蛋白。
所以SUMO标签也常用于与其她标签一起应用,作为特异酶切水解位点。
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