1、CTAB buffer【1】2. 70%乙醇【2】3. RNaseA (天根)【3】4. 0.5TBE缓冲液(工作浓度)【4】5. 6loading buffer【5】6. 核酸染料(赛百盛)7. DNA marker DL 2000(Takara)8. 酚/氯仿 (1:1, V/V) 【6】【实验步骤】1. 取约100 mg新鲜地拟南芥嫩叶放入1.5 mL EP管,在液氮冷冻条件下研磨成粉末状.2. 加入0.6 mL 2CTAB提取液(用前加入0.2地巯基乙醇),混匀,65水浴30 min,每10 min颠倒混匀一次.xHAQX。3. 取出离心管,冷却后加入0.6 mL酚氯仿混合液,混匀.4
2、. 11,500 rpm室温离心8 min(若没离好可重复一次).5. 将上清液(约400 L)转移到另一新地1.5 mL离心管中.6. 加入与上清等体积地氯仿,混匀,11,500 rpm 离心8 min,取上清(约350 L).7. 加入600 L无水乙醇,上下颠倒混匀,-80放置30 min.8. 4,15,800 rpm离心20 min,弃上清.9. 1 mL 70乙醇(预冷)洗涤沉淀2次,上下颠倒几次,不能vortex,7,000 g离心3 min,弃上清,风干.LDAYt。10. 加入30 L无菌水(含20 g/mL RNase A),37溶解DNA 30 min.11. 取5 L
3、DNA样品进行琼脂糖凝胶电泳检测:(1) 制备琼脂糖凝胶称取0.3 g 琼脂糖,放入三角瓶中,加入30 mL 0.5 TBE缓冲液,置微波炉中加热至完全熔化,取出摇匀,则为1琼脂糖凝胶液.Zzz6Z。(2) 胶板地制备取有机玻璃内槽,洗净,晾干,用橡皮膏或胶带将有机玻璃内槽地两端边缘封好(一定封严,不能留缝隙),形成一个模具.dvzfv。将有机玻璃内槽放置于一水平位置,并在固定位置放好样品梳子.待琼脂糖凝胶液冷却到60左右时,加入核酸染料1.5 L,摇匀,缓缓倒入有机玻璃内槽,直至有机玻璃板上形成一层均匀地胶面(注意不要形成气泡).rqyn1。室温下静置直至凝胶完全凝固(室温下30-45 mi
4、n),垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.Emxvx。加入0.5 TBE电泳缓冲液至电泳槽中,使缓冲液没过胶面约1 mm.(3) 加样在点样板或parafilm上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液地最终稀释倍数应不小于1.用10 L微量移液器分别将样品加入胶板地样品小槽内,将DNA marker分别加至样品孔地左侧和右侧孔内.每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围地凝胶面(注意:加样前要先记下加样地顺序).SixE2。 (4) 电泳接通电泳槽与电泳仪地电源,DNA片段从负极(黑色插头)向正极(红色插头)移动).DNA地迁移速度与电压成正比,但电压升
5、高使琼脂糖凝胶地有效分离范围降低,因此,最高电压不超过5V/cm.6ewMy。当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1-2cm处,停止电泳.紫外灯下观察琼脂糖凝胶中地带(戴手套操作),采用凝胶成像系统拍照保存.12.紫外分光光度法测定DNA浓度及纯度:(1) 用0.1TE对待测DNA样品按1:20或合适地倍数稀释.(2) 开机,仪器会自动对光路及分析软件进行检测,待显示屏上出现“instrument Ready”时,进入核酸测定窗口.kavU4。(3) 调零.先用0.1TE缓冲液注入样品杯,放入样品槽,关闭盖板.点击“set ref”键,仪器自动校正零点.将样品槽内地样品杯取出,换上待测样品.y6v3A
6、。(4) 吸70 L已稀释地DNA样品转入石英样品杯,放入样品槽,关闭盖板.如果样品很少,可以用5-7 L地石英样品杯.点击“enter” 键,仪器即进入分析状态.窗口同时显示260 nm和280 nm处地光密度(OD值)及A260/A280 nm和A280/A260 nm地比率以及DNA样品地浓度等.M2ub6。(5) 打开盖板,取出石英样品杯,吸出样液,用超纯水清洁石英样品杯,风干后,再加入下一个待测样品.(6) DNA纯度:以A260/ A280比值来反映.当A260 /A280比值2.0,说明样品存在RNA污染,可以用RNA酶处理样品去除RNA.0YujC。实验结果与分析1. 1%地琼
7、脂糖凝胶电泳检测拟南芥基因组DNAC组电泳结果如图所示1%地琼脂糖凝胶电泳检测所提取地DNA 5l样品,电泳结果如图所示有DNA条带出现,表明已经成功提取到了拟南芥地基因组DNA.2.DNA样品地OD检测检测OD值C1:浓度:1061.7 ng/OD260/OD280:1.87表明:C1接种DNA质量良好.(如下图所示)C2:1017.6ng/ 1.86表明:C2接种DNA质量良好.(如下图所示)C3:711.0ng/ C3接种DNA质量良好.(如下图所示)注意事项:1、磨样时要反复插入液氮中冷冻,但要避免液氮进入管中;2、取酚氯仿混合液时要吸取下层;3、加入酚氯仿和氯仿时要充分混匀;4、氯仿
8、抽提后取上清时不要吸到蛋白层;5、晾干沉淀时,要尽可能地吸除酒精.实验二 PCR扩增目地片段通过本实验学习PCR反应地基本原理与实验技术.聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是一种体外核酸扩增系统,其原理类似DNA分子地天然复制过程,是将待扩增地DNA片段与其两侧互补地两个寡聚核苷酸引物,经变性、退火和延伸若干个循环后,DNA扩增2n倍.eUts8。典型地PCR 反应体系由如下组分组成:DNA 模板、反应缓冲液、dNTP、两个合成地DNA引物、耐热DNA聚合酶.PCR地工作程序实际上是一个在模板DNA、一对已知序列地寡核苷酸引物和四种脱氧核苷酸等存在地情
9、况下,DNA聚合酶依赖地酶促合成反应.整个扩增过程分三步:变性,加热使模板DNA双链间地氢键断裂而形成两条单链,即变性阶段;退火,快速降低温度至50-60后,模板DNA与引物按碱基配对原则互补结合,即退火阶段;延伸,溶液反应温度升至72,耐热DNA聚合酶以单链DNA为模板,在引物地引导下,利用反应混合物中地4 种脱氧核苷三磷酸(dNTP),按53方向复制出互补DNA ,即引物地延伸阶段.完成以上三步为一个循环,每经过一个循环,样本中地DNA量就增加一倍,新形成地DNA链又成为下一轮循环地模板.经过25-30个循环后,DNA可扩增106-109倍.PCR扩增地特异性取决于引物与模板DNA地结合.
10、sQsAE。PCR热循环仪、台式离心机、电泳仪、凝胶成像系统、移液器(0.1-2.5 L)、200 L PCR管、吸头、离心管、手套、制冰机、微量移液器(10、100、1000 L量程各一支)、100 mL或250 mL锥形瓶、量筒、点样板或parafilm、吸头、PE手套和乳胶手套.GMsIa。二、试剂1. 10 缓冲液2. DNA 模板 1 ng/L(以实验一提取地拟南芥基因组DNA为模板)3. dNTP Mix (Takara)4引物P3:5-CGG GTA CCG GTG AAT TAA GAG GAG AGA GGA GG-3TIrRG。P5:5-ACT CTA GAT GAG TA
11、A AAC AGA GGA GGG TCT CAC-37EqZc。引物溶液浓度:2 M 5. rTaq 酶 5 U/L6. 低熔点琼脂糖7. 去离子水或TE(pH7.6)【7】1在200 L PCR 管内配制20 L 反应体系:反应物体积/LddH2O 11.3 10PCR 缓冲液 2.0dNTP 1.6(终浓度20200 M)引物1 2.0(引物终浓度0.2 M)引物2 2.0(引物终浓度0.2 M)模板DNA 1.0rTag 酶 0.1 Total 20 视PCR仪有无热盖,不加或添加石蜡油.2. 将上述试剂依次加入PCR薄壁管.加样后用手轻弹混匀,6,000 rpm离心15 sec使反应
12、成分集于管底.3. PCR反应热循环程序设置: 94 预变性3 min; 94 变性 30 sec; 64 退火 30 sec; 30 cycles 72 延伸 1 min; 72 延伸 10min; 16 pause反应结束后短暂离心,置4保存备用.4. 配制1地琼脂糖凝胶.5. 取5 L PCR产物,加1 L地6 loading buffer(上样缓冲液),轻弹混匀后进行电泳检测.lzq7I。6. 如果PCR产物非常特异,可以直接用于与载体地重组连接.【实验结果】本实验扩增片段长652 bp.1、加样时要精确用移液器.2、检查PCR仪是否热盖. 3、每种试剂弹化后要离心;做MIX时,最后加
13、酶,分装之前要混匀;分装后需离心混匀.实验二地PCR扩增用1%地琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物,电泳结果如图所示,有DNA条带,约600 bp;或者无DNA条带.zvpge。版权申明本文部分内容,包括文字、图片、以及设计等在网上搜集整理.版权为个人所有This article includes some parts, including text, pictures, and design. Copyright is personal ownership.NrpoJ。用户可将本文地内容或服务用于个人学习、研究或欣赏,以及其他非商业性或非盈利性用途,但同时应遵守著作权法及其他相关法律地规定,不
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