1、2、简并性:密码子简并,即一种AA有几种不同密码子的现象。同义密码子,即编码同一种AA的不同密码子。3、无标点符号4、不重叠性(有少数例外)5、通用性,所有生物的几乎一样,第二节 核糖体,核糖体是蛋白质合成的部位。主要成分蛋白质和RNA(rRNA是构成核糖体的主要组成部分)。功 能:按照mRNA 的指令合成多肽链。(N端向C端合成),mRNA,核糖体,核糖体是合成蛋白质的细胞器,原核生物(细菌、放线菌、蓝绿藻)70S 50S(5SrRNA,3SrRNA)30S(16SrRNA)A位:氨酰-tRNA结合部位(AA位)P位:肽酰-tRNA结合部位(肽位),P,A,50S,30S,第三节 转移RNA
2、的功能,一、多肽合成与tRNA的关系 tRNA分子上与蛋白质生物合成有关的位点至少有4个,即3一CCAOH,是AA接受位点;识别氨酰-tRNA合成酶的位点;核糖体识别位点,使延长中的肽链附着于核糖体上;反密码子位点。(每一个tRNA都有一个由3个核苷酸组成的特殊的反密码子),tRNA反密码子与mRNA密码子的配对特点,tRNA反密码子可以根据碱基配对的原则,与mRNA上对应的密码子相结合,密码子与反密码子之间的碱基对,I G C mRNA 3-A C G-5(Ala),5 3,储存在mRNA的遗传密码称为第一套密码系统储存在tRNA的遗传密码称为第二套密码系统,第四节 蛋白质的生物合成,一、蛋
3、白质合成系统的重要组分1、mRNA的作用机制2、核糖体的作用机制3、tRNA的作用机制,二、蛋白质合成过程的分子机制,(一)氨基酸的活化 COOH被活化(酰化反应实现)AA+tRNA+ATP 氨基酰-tRNA+AMP+PPi E:氨基酰-tRNA合成酶,(二)肽链的合成(以原核生物为例),1、起始阶段:在核糖体上合成多肽。fMet-tRNA占据了核糖体上的P位(此过程消耗一个GTP),空的A位准备接受下一个氨酰-tRNA。起始的完成以核糖体大小亚基、mRNA和 fMet-tRNA形成复合物作为标志。,2、延长阶段,(1)进位:新的氨酰-tRNA进入A位。消耗一个GTP。(2)转肽:形成新的肽键
4、 P位 A位 P位 A位 CHO NH NH2 R1CH+R2CH tRNA+?O=C O=C O-tRNA O-tRNA 思考:提供COOH的AA在哪一位。,E:exit siteP siteA site,(3)脱落:空载的tRNA从P位上脱落。(4)移位:核糖体沿mRNA的53方向移动,同时,原处于A部位带有肽链的tRNA随即到P部位,使A位空出来。(消耗一个GTP)以上4个步骤一再重复,直至肽链增长到必需的长度,3、终止阶段,包括两个事件:(1)在mRNA上识别终止密码子(UAA、UAG、UGA);(2)水解所合成肽链与tRNA间的酯键,释放肽链。tRNA从P位上脱落下来,70S核糖体也
5、从mRNA上脱落,解离为30S及50S亚基并立即投入下一轮核糖体循环,以合成另一新的蛋白质分子。,思考题:合成一个五肽至少需要多少能量?(能量供体的主要形式是GTP),(三)翻译后加工,肽链蛋白质(有功能的)1、N末端AA或部分肽段的切除 以原核生物为例:fMet-xx-xx-脱甲酰基酶 Met-xx-xx-氨肽酶 切去一个或多个N端AA,2、信号肽的切除:信号肽酶3、SS的形成 mRNA中没有(Cys)2的密码子4、AA的修饰:羟基化、甲基化等 eg 胶原中的羟脯氨酸(羟基化)5、亚基之间、亚基与辅基之间的聚合。6、多肽链折叠成有活性的构象。,信号肽及识别信号肽的信号识别体的结构特征,目前通
6、常所说的信号肽是指翻译产物,新生肽链N端引导新生肽链进入内质网的肽段。这种信号肽一般含有约20个氨基酸残基,从其结构看,中间集中了较多的疏水性残基,两端是一些极性的残基。*信号肽有时也可位于多肽链的中部。,识别信号肽的识别体,称为信号肽识别颗粒(SRP)。它是7SL RNA和6条不同分子量的肽链组成的复合物。除了和信号肽结合外,识别颗粒还可以和其它一些帮助新生肽穿越内质网膜的蛋白质(或复合物)结合,后者为停泊蛋白或核糖体受体等。,真核生物与原核生物蛋白质合成过程的不同点,真核生物蛋白质合成过程的不同点,起始AA-tRNA为Met-tRNA。40S亚基首先识别mRNA5端,然后移动到起始位点(原核生物起始复合物直接在AUG处形成)。小亚基不首先与mRNA结合。核糖体各种因子不同于原核生物。,