1、生物化学名词解释整理版章节根据人民卫生出版社第7版生物化学划分参考教学PPT、各教辅术后习题及试卷标准答案 整理录入/清水秋香第一章 蛋白质结构与功能isoelectric point, pI：氨基酸的等电点：在某一pH的溶液中，氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等，成为兼性离子，呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。Peptide bond：肽键。由一个氨基酸的a-羧基与另一个氨基酸的a-氨基脱水缩合而形成的酰胺键。Glutathione,GSH：谷胱甘肽。由谷氨酸，半胱氨酸，甘氨酸组成的三肽。是体内重要的还原剂。peptide unit：肽单元。参与肽键的6个原子Ca1、C
2、、O、N、H、Ca2位于同一平面，Ca1和Ca2在平面上所处的位置为反式(trans)构型，此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元。peptide plane:肽平面。肽链主链的肽键C-N具有部分双键的性质，因而不能自由的旋转，使连接在肽键上的六个原子共处于一个平面上，此平面称为肽单位平面，又称酰胺平面。通常是反式的。-helix:-螺旋。常见的蛋白质二级结构之一。为具有最大氢键联系的右手螺旋，侧链伸向螺旋外侧，每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈，螺距0.54nm。motif：模体。在一个或几个蛋白质中出现的2个或2个以上二级结构元件的不同折叠形式，又称折叠或超二级结构。也是在DNA中对特殊序
3、列的描述。 zinc finger：锌指结构。一种常见的模体。由1个 -螺旋和2个反平行的-折叠共3个肽段组成,形似手指, 能够结合锌离子,锌指具有结合DNA的功能。Domain：结构域：大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域，折叠得较为紧密，各行使其功能，称为结构域(domain) 。Molecular chaperon：分子伴侣。是细胞内一类可识别肽链的非天然构象、促进各功能域和整体蛋白质正确折叠的保守蛋白质。Cooperativity:协同效应。一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后，能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象，称为协同效应。 如果是促进作用则
4、称为正协同效应 如果是抑制作用则称为负协同效应 allosteric effect:变构效应。蛋白质因与小分子物质相互作用而发生空间结构的改变，导致蛋白质功能的变化，称为变构效应。Protein PI:蛋白质等电点。当蛋白质溶液处于某一pH时，蛋白质解离成正、负离子的趋势相等，即成为兼性离子，净电荷为零，此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。Denaturation:蛋白质的变性。在某些物理和化学因素作用下，其特定的空间构象被破坏，即有序的空间结构变成无序的空间结构，从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。Renaturation:蛋白质的复性。若蛋白质变性程度较轻，去除变性因素后，蛋白质仍可恢复
5、或部分恢复其原有的构象和功能第二章 核酸的结构与功能gene基因：位于染色体上遗传基本单位或单元，是负载特定遗传信息的DNA片段，可以编码单个具有生物功能的产物，包括RNA和多肽链。genome基因组：一个生物体的全部遗传信息，即DNA的全部核苷酸序列。但有些病毒是RNA。snmRNA：非mRNA小RNA，包括snRNA（核内小RNA）,snoRNA（核仁小RNA）,scRNA（胞质小RNA）,催化性小RNA，siRNA（小片段干扰RNA）。这些小RNA在hnRNA和rRNA的转录后加工、转运以及基因表达过程的调控等方面有非常重要的生理作用。DNA denature ：DNA变性。双链DNA在
6、变性因素（如加热、过酸性条件、过碱性条件等）影响下，解离成为两条单链的过程称之为DNA变性。Hyperchromic effect增色效应：DNA变性时，双螺旋变得松解，碱基暴露，使得含有DNA的溶液在260nm的光吸收值升高的效应。Tm解链温度：DNA在解链过程中，紫外吸光度的变化A260达到最大变化值的一半时对应的温度称为DNA的解链温度。在此温度时，50%的DNA双链被打开。renaturation复性：当变性条件缓慢地除去后，两条解离的互补链可重新配对，恢复原来的双螺旋结构，这一现象称为复性。RNAi:RNA干涉。是由双链siRNA介导的抑制靶基因表达的现象。annealing退火：变
7、性的双链DNA经缓慢冷却后，两条互补链重新恢复天然的双螺旋构象的过程。Nucleosome核小体：染色质的基本组成单位，由DNA和5种组蛋白组组成。各2分子的H2A,H2B,H3,H4共同构成了核小体的核心，DNA以左手螺旋的形式缠绕在这一核心上构成了核小体。Hybridization核酸分子杂交：不同种类的DNA单链或RNA放在同一溶液中，只要两种单链分子之间存在这一定程度的碱基配对关系，他们就有可能形成杂化双链，这种现象称为核酸分子杂交。第三章 酶Ribozyme：核酶。是具有催化作用的核糖核酸。Km 米氏常数。是单底物反应中酶与底物可逆地生成中间产物和中间产物转化为产物这三个反应的速度常
8、数的综合。米氏常数等于反应速度为最大速度一半时的底物浓度。Coenzyme：辅酶。结合酶中的辅助因子为小分子有机化合物称为辅酶。参与酶的催化过程。与酶蛋白共价结合的部分称为辅基。Essential group：酶的必需基团。酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中，一些与酶活性密切相关的化学基团。分为结合基团和催化基团两类。Active center活性中心：指必需基团在空间结构上彼此靠近，组成具有特定空间结构的区域，能与底物特异结合并将底物转化为产物。Isoenzyme,isozyme：同工酶。指催化相同化学反应，但酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。是由不同基因编码的多肽链，或
9、同一基因转录生成的不同mRNA所翻译的不同多肽链组成的的蛋白质。Optimum temperature最适温度：酶促反应速率最快时反应体系的温度称为酶促反应的最适温度。Activator激活剂：使酶由无活性变为有活性或使酶活动性增加的物质称为酶的激活剂。Allosteric regulation：变构调节。代谢物与关键酶分子活性中心以外的某个部位可逆的结合，使酶发生变构而改变其催化活性的这种调节方式称为变构调节。Chemical modification化学修饰：酶蛋白上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合，从而改变酶的活性，这一过程称为酶的化学修饰。包括磷酸化与脱磷酸化，乙酰化与脱乙
10、酰化，甲基化与脱甲基化，腺苷化与脱腺苷化，以及巯基与二硫键的互变等。第四章 糖代谢PPP:磷酸戊糖途径(pentose phosphate pathway)是指由葡萄糖生成磷酸戊糖及NADPH+H+，前者再进一步转变成3-磷酸甘油醛和6-磷酸果糖的反应过程。glycolysis糖酵解：在机体缺氧条件下，葡萄糖经一系列酶促反应生成丙酮酸进而还原生成乳酸的过程称为糖酵解，亦称糖的无氧氧化(anaerobic oxidation)。 substrate cycle底物循环：作用物的互变反应分别由不同的酶催化其单向反应，这种互变循环被称为底物循环(substrate cycle)。当两种酶活性相等时，
11、就不能将代谢向前推进，结果仅是ATP分解释放出能量，因而又称为无效循环(futile cycle)。Glycolytic pathway:糖酵解途径。由葡萄糖分解成丙酮酸(pyruvate)，称之为糖酵解途径。Tricaboxylic acid cycle TAC：三羧酸循环。指乙酰CoA和草酰乙酸缩合生成含三个羧基的柠檬酸，反复的进行脱氢脱羧，又生成草酰乙酸，再重复循环反应的过程。Paster effect：巴斯德效应：糖有氧氧化抑制糖酵解的现象称为巴斯德效应。Glycogenesis糖原合成：由葡萄糖合成糖原的过程称为糖原合成glyconeogenesis糖异生：由非糖化合物转变为葡萄糖或
12、糖原的过程称为糖异生Lactic acid cycle乳酸循环：（画图）Cascade system级联放大系统：经一系列酶促反应将激素信号放大的连锁反应称为级联放大系统。第五章 脂类代谢Ketone bodies酮体：指脂酸在肝脏线粒体内分解时产生的特有中间产物乙酰乙酸，-羟丁酸及丙酮的总称。是肝脏对外输出能量的一种形式。Chylomicron LM乳糜微粒：是脂蛋白的一种形式，由小肠粘膜细胞合成的甘油三酯，与磷脂、apoB48等构成。主要功能为转运外源性的甘油三酯和胆固醇。Fat mobilization脂肪动员：是指储存在脂肪细胞中的甘油三酯，被脂酶逐步水解为游离脂酸和甘油并释放入血，通
13、过血液运输至其他组织氧化利用的过程。LDL receptor LDL受体：介导LDL内吞的脂蛋白受体，又称apoB,apoE受体，广泛分布于肝、动脉壁细胞等各组织的细胞膜表面。Apolipoprotein,apo载脂蛋白：脂蛋白的蛋白质部分。在结合和转运脂质及稳定脂蛋白结构上发挥着重要作用，而且还调节脂蛋白代谢关键酶的活性，参与脂蛋白受体的识别。LPL脂蛋白脂酶：血管内皮细胞表面的一种水解血浆脂蛋白中甘油三酯的酶。Lipase脂酶：催化甘油三酯水解的酶。甘油一酯途径（画图）第六章 生物氧化Oxidative respiratory chain氧化呼吸链：又称电子传递链，指线粒体内膜中按一定顺序
14、排列的具有电子传递功能的酶复合体，可通过连锁的氧化还原反应将电子传递给氧生成水。这一系列的酶和辅酶称为氧化呼吸链。Oxidative phoshorylation氧化磷酸化：既由代谢物脱下的氢，经线粒体氧化呼吸链电子传递释放能量，偶联驱动ADP磷酸化生成ATP的过程。Bilogical oxidation生物氧化：物质在生物体内进行氧化称生物氧化，主要指糖、脂肪、蛋白质等在体内分解时逐步释放能量，最终生成CO2 和 H2O的过程。substrate level phosphorylation底物水平磷酸化：与脱氢反应偶联，直接将高能代谢分子中的能量转移给ADP(GDP)磷酸化生成ATP(GTP
15、)的过程。Chemisomotic hypothesis化学渗透假说：电子经呼吸链传递时，驱动质子从线粒体内膜的基质侧转移到内膜胞质侧，形成跨线粒体内膜的质子电化学梯度，以此储存电子传递释放的能量。当质子顺浓度梯度回流时驱动ADP磷酸化生成ATP。P/0比值：指氧化磷酸化过程中，每消耗1/2摩尔O2所生成ATP的摩尔数。ATP synthase：ATP合酶。位于线粒体内膜催化ATP合成的酶，由F1亲水部分和F0疏水部分组成。第七章 氨基酸代谢ubiquitin泛素：一种高度保守的小分子蛋白质，在细胞内蛋白质的蛋白酶体降解途径中，在特异泛素化酶催化下，几个泛素分子串联地共价结合至靶蛋白的赖氨酸残
16、基。Nitrogen balance氮平衡：摄入食物的含氮量与排泄物（尿与粪）中含氮量之间的关系。间接可以反应体内蛋白质代谢状况。Nutritionally essential amino acid营养必需氨基酸：体内需要又不能自身合成，必须由食物提供的氨基酸，称为必需氨基酸。包括缬氨酸，异亮氨酸，亮氨酸，甲硫氨酸，色氨酸，苏氨酸，赖氨酸。nutrition value蛋白质的营养价值：是指食物蛋白质在体内的利用率，取决于必需氨基酸的数量、种类、量质比。putrefaction腐败作用：肠道细菌对未被消化的蛋白质及其消化产物所起的作用。metabolic pool氨基酸代谢库：食物蛋白质经消化
17、吸收的氨基酸（外源性氨基酸）与体内组织蛋白质降解产生的氨基酸及体内合成的非必需氨基酸（内源性氨基酸）混在一起，分布于体内各处参与代谢，称为氨基酸代谢库(metabolic pool) 。transdeamination联合脱氨所用：两种脱氨基方式的联合作用，使氨基酸脱下-氨基生成-酮酸的过程， 如转氨作用和谷氨酸脱氢作用的结合。One carbon unit一碳单位：某些氨基酸在分解代谢过程中产生的含有一个碳原子的基团，称为一碳单位，包括甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基、亚胺甲基等。其生理功能是作为合成嘌呤及嘧啶的原料。Y-glutamyl cycle。Y-谷氨酰基循环。指通过谷胱甘肽的代谢作用将
18、氨基酸吸收和转运到体内的过程。第八章 核苷酸代谢de novo synthesis从头合成途径：利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及CO2等简单物质为原料，经过一系列酶促反应，合成嘌呤核苷酸的过程。salvage pathway补救合成途径：利用体内游离的碱基或核苷，经过简单的反应过程，合成核苷酸的过程。第十章 DNA的生物合成Semi conservative replication半保留复制：DNA复制是以DNA的两条链为模板，以dNTP为原料，在DNA聚合酶的作用下按照碱基配对规律合成新的互补链，这样形成的两个子代DNA分子与原来的DNA分子完全相同，故称之为复制，子代自带DNA分子的双链其
19、中一条来自亲代，另一条是新合成的，故名半保留复制。Okazaki fragment冈崎片段：DNA复制时，随从链复制中形成的不连续片段。The central dogma中心法则：遗传信息从DNA向RNA，再向蛋白质传递的规律（画图）primosome引发体：是复制起始时形成的，在原核生物DnaB（解螺旋酶）、DnaC、DnaG（引物酶）等蛋白质结合到DNA起始复制区域形成的复合结构。Lagging strand随从链：DNA合成过程中，一条链合成方向与复制叉的移动方向相同，可以连续合成，另一条链的合成方向与复制叉的移动方向相反，不能连续合成，先合成片段，然后连接成新链，这称为随从链。Repl
20、icon复制子：基因组中能独立进行复制的结构单位称复制子。包含起始位点和终止位点，从起始位点至终止位点的全部DNA。Klenow fragment片段：是原核生物DNA-pol经特异的蛋白酶水解后产生的大片段，具有DNA聚合酶活性和35核酸外切酶活性。Klenow是实验室合成DNA和进行分子生物学研究中常用的工具酶（代替DNA聚合酶）。Reverse transcription逆转录：逆转录(1分)，RNA病毒的复制方式，在基因工程中，可用于以mRNA为模板合成cDNA。在RNA病毒中逆转录酶催化下，以RNA为模板催化合成DNA的过程(1分)。Excision repair切除修复：细胞内最重
21、要的修复机制。包括去除损伤的DNA，填补空隙和连接。主要由DNA聚合酶及连接酶执行。Telomere端粒：是真核生物染色体线性DNA分子末端的结构。形态学上，DNA末端与它的结合蛋白质紧密结合，像两顶帽子那样盖在染色体两段，使染色体DNA末端膨大成粒状。在维持染色体的稳定性和DNA复制的完整性上起着重要作用。Integration整合：RNA病毒在细胞内复制成双链DNA的前病毒，保留了RNA病毒复制的全部遗传信息，在某些情况下，前病毒基因组通过基因重组，参加到细胞的基因组内，并随宿主基因一起复制和表达，这种重组方式称为整合。第十一章 RNA的生物合成RNA polymerase RNA聚合酶：
22、以DNA或RNA为模板，以5三磷酸何干为原料催化合成RNA的酶。Structural gene结构基因：能转录出RNA的DNA区段称为结构基因。Asymmetric transcription不对称转录：基因组中，按细胞不同的发育时序、生存条件和生理需要，只有少部分基因发生转录。有两方面含义：在DNA分子双链上，一股链作为模板指引转录，一股链不转录；其二是模板链并非总是在同一单链上。Coding stand编码链：DNA双链中不用做转录模板的一股单链，起碱基序列除了无T有U外，和产物mRNA序列相同而得名。若用单链写出DNA序列，可只写编码链。 Core enzyme核心酶：RNA聚合酶的2亚
23、基合称核心酶。与转录全过程有关，可催化NTP按模板的指引合成RNA。Holoenzyme全酶：RNA聚合酶的加上核心酶成为全酶。PIC转录起始前复合物：是真核生物TF之间互相辨认结合，并结合RNA-pol II而进入启动子核心区TATA；由各种TF，RNA-pol与转录的基因上游DNA三者结合而成的复合体。transcription bubble转录空泡：由RNA-pol，局部解开的DNA双链及转录产物RNA 3-端的一小段依附于DNA模板链而组成的转录延长过程的复合物。CTD羧基末端结构域：RNA聚合酶最大亚基的羧基末端有一段共有序列为Tyr-Ser-pro-Thr-Ser-Pro-Ser(
24、老师傅酥吃不吃)的重复序列片段，称为羧基末端结构域。它是维持细胞活性所必须，去磷酸化的CTD在转录起始中发挥作用。Enhancer增强子：是能够结合特异基因调节蛋白，促进邻近或远隔的特定基因表达的DNA序列。trans-acting factors：反式作用因子(1分)，能特异性识别(1分)DNA编码区上游存在的具有调控该基因表达速率的序列并与之结合的蛋白质因子(1分)。 cis-acting elements：顺式作用元件(1分)，指DNA编码区上游存在的具有调控该基因表达速率的序列(1分)，可被相应的蛋白质因子识别并结合(1分)。TF转录因子：反式作用因子中，直接或间接结合RNA聚合酶的，
25、成为转录因子。Split gene断裂基因：真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。exon外显子在真核生物中断裂基因及其初级转录产物上出现，并表达为成熟RNA的核苷酸序列。intron内含子真核生物中隔断基因的线性表达，而在剪接过程中被减去的核酸序列。self-splicing自剪接，由RNA分子催化自身内含子剪接的反应称自剪接，因此是一种核酶。第十二章 蛋白质的生物合成translation翻译：细胞内以mRNA为模板、按照mRNA分子有核苷酸组成的密码信息合成蛋白质，由于mRN
26、A中的核苷酸排列顺序与蛋白质中的氨基酸排列顺序是两种不同的分子语言，所以将蛋白质的生物合成称为翻译。Promoter启动子：是RNA聚合酶结合的、在转录起始上游的DNA序列，RNA聚合酶与之结合后如不受阻遏，即可开始转录。Upstream promotor element启动子上游元件：位于启动子上游的DNA序列，多在转录起始点-40nt-100nt的位置，比较常见的是GC盒和CAAT盒，从近端调控转录起始复合物的效率和专一性。ORF开放阅读框：从mRNA 5-端起始密码子AUG到3-端终止密码子之间的核苷酸序列，称为开放阅读框架。多顺反子：一条mRNA编码几种功能相关的蛋白质codon密码子
27、：在mRNA的开放阅读框架区，以每3个相邻的核苷酸为一组，代表一种氨基酸(或其他信息)，这种三联体形式的核苷酸序列称为密码子。共有64个密码子，阅读方向是53。mRNA editing mRNA编辑：许多真核生物基因转录后有一个对mRNA外显子加工的过程，可通过特定碱基的插入、缺失或置换，使mRNA序列中出现移码突变、错义突变或无义突变，导致mRNA与其DNA模板序列不匹配，使同一前体mRNA翻译出序列、功能不同的蛋白质。这种基因表达的调节方式称为mRNA编辑。wobble base pairing摆动配对：反密码子与密码子之间的配对有时并不严格遵守常见的碱基配对规律，这种现象称为摆动配对。T
28、ranscription factor转录因子：为基因转录激活或增强转录频率所需要的所有DNA结合蛋白，分为基本转录因子和特异转录因子。frame shift mutation框移突变：指三联体密码的阅读方式改变，造成蛋白质氨基酸的排列顺序发生改变，其后果是翻译出的蛋白质可能完全不同。Shrine-Dalgarno sequence，S-D序列 ：原核生物位于mRNA编码区上游的一个（富含嘌呤碱基）短片段（多为6个，AGGAGG），能与30S小亚基中的16S rRNA3端的一段富含嘧啶碱基的短序列（UCCUCC）互补，使核糖体能正确地在mRNA上定位。Polysome多聚核糖体：由多个核蛋白体
29、结合在一条mRNA链上，同时进行多肽链的合成所形成的聚合物成为多聚核糖体。posttranslational modification翻译后修饰：新生多肽链经过复杂的加工过程转变为具有天然构象的功能蛋白质。翻译后修饰包括多肽链折叠为天然的三维构象及对肽链一级结构的修饰、空间结构的修饰等。signal peptitide信号肽：某些蛋白质N-端有一段氨基酸的序列，指导蛋白质传送到特定位置。到达特定位置后由酶水解除去。NLS核定位序列：所有靶向运送到细胞核的蛋白质其多肽链内含有特异信号序列，称为核定位序列。Protein targetting靶向输送：蛋白质合成后被定向输送到其发挥作用的靶位点的过
30、程称为蛋白质的靶向运送。antibiotics抗生素：是一类由某些真菌、细菌等微生物产生的药物，有抑制其他微生物生长或杀死其他微生物的能力。对宿主无毒性的抗生素可用于预防和治疗人、动物和植物的感染性疾病。interferon：干扰素，真核细胞受病毒感染后产生的生物活性物质，本质是蛋白质。通过一些特异的机制抑制宿主细胞的蛋白质合成及降解病毒的mRNA，从而起抗病毒的作用。第十三章 基因表达调控temporal sepcificity时间特异性：某一特定基因的表达严格按一定的时间顺序发生，又称为阶段特异性。Spatial sepcificity空间特异性：在个体生长发育的过程中，一个基因产物在个体
31、的不同空间出现，这就是基因表达的空间特异性。Constitutive expression组成性表达：有些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达，通常被称为管家基因。它们较少受环境因素影响，而且在个体各个生长阶段的几乎所有组织中都持续表达。这类基因表达称为基本表达或组成性表达。housekeeping gene管家基因：对生命全过程都是必需的或必不可少的一类基因。这类基因在一个生物个体的几乎所有细胞都持续表达。Inducible gene可诱导基因：在特定环境信号刺激下，相应的基因可被激活，基因表达产物增加，这种基因称为可诱导基因 (inducible gene)。Induction诱导：可诱
32、导基因在特定环境中表达增强的过程，称为诱导（induction）。coordinate expression协调表达：在一定机制控制下，功能相关的一组基因，无论其为何种表达方式，均需协调一致、共同表达。enhancer增强子：增强子是能够结合特异基因调节蛋白，促进邻近或远处特定基因表达的DNA序列。增强子距转录起始点的距离变化会很大，但总是作用于最近的启动子。Trans-acting factor反式作用因子：也称真核转录调节因子。由它编码基因表达后，通过与特异的顺式作用元件识别、结合，反式激活另一基因的转录。顺式调节：有些基因可特异识别、结合自身基因的调节序列，调节自身基因的开启或关闭，这就是顺式调节作用
